新生荷斯坦犊牛后肠道微生物母源传递特征的研究

摘要

本试验旨在探讨新生荷斯坦犊牛后肠道微生物区系的母体来源.利用16S rDNA扩增子测序技术分析6对荷斯坦母牛的胎盘、脐带、羊水、初乳、粪便和犊牛胎粪的微生物区系特征,结合SourceTracker方法研究母牛不同部位微生物对犊牛后肠道菌群的定植贡献.结果表明:所有样本类型都有特异性操作分类单元(OTU).羊水和初乳、胎盘和脐带微生物区系结构相似;母牛粪便和犊牛胎粪具有独特的微生物区系.母牛的胎盘、脐带、羊水、初乳和粪便中的微生物均是新生犊牛胎粪微生物的主要来源,按贡献比例由高到低依次为脐带(23.45％)、胎盘(16.35％)、初乳(14.29％)、羊水(11.45％)、母牛粪便(9.93％).本试验证明,围产期母牛胎盘、脐带、羊水、初乳和粪便中的微生物可通过母源传递方式在犊牛肠道中进行定植,其中脐带微生物对胎粪微生物的定植贡献最大.犊牛胎粪中还有许多未知来源且相对贡献度(24.53％)较高的微生物.