基于网络药理学方法和分子对接技术探究六君二陈解毒汤治疗非小细胞肺癌的潜在作用机制

摘要

目的利用网络药理学方法和分子对接技术,探究六君二陈解毒汤治疗非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的潜在作用机制。方法基于网络药理学方法检索TCMSP数据库收集六君二陈解毒汤的药物活性成分,并预测其作用靶点;检索GenCards、OMIM、PharmGKB数据库获得NSCLC疾病靶点;使用Venny(2.1)在线工具获得药物活性成分与疾病的交集靶点后,通过STRING数据库构建蛋白互作图并做拓扑学分析;使用Cytoscape Version(3.9.2)软件的MCODE插件对核心靶点进行聚类分析;使用DAVID数据库对核心靶点进行GO生物功能和KEGG通路富集分析;运用Kaplan-Meier Plotter数据库对核心靶点进行生存分析。基于分子对接技术使用AutoDock(1.5.6)软件对网络药理学预测结果进行分子对接验证。结果基于网络药理学方法得到六君二陈解毒汤的主要活性成分198个、潜在作用靶点968个;检索疾病数据库收集筛选得到NSCLC靶点1093个,取交集后得到NSCLC治疗靶点12个。蛋白互作图和拓扑学分析结果显示,EGFR、CAV1、PTEN等10个靶点可能是六君二陈解毒汤治疗NSCLC的核心靶点。聚类分析得到1个具有相似功能的子簇,涉及PARK2、MCL1、EGFR等8个核心靶点。GO生物功能和KEGG通路富集分析表明,六君二陈解毒汤通过影响癌症信号通路和FAK、PI3K-act等信号通路发挥作用。生存分析结果显示,EGFR、CAV1、PTEN、MCL1、MET、RASA1、VCAM1核心靶点的表达与NSCLC患者总生存率有关。基于分子对接技术得到六君二陈解毒汤活性成分中β-谷甾醇与核心靶点MCL1有较好的结合能力,其结合能为-4.33 kJ/mol。结论基于网络药理学方法预测出六君二陈解毒汤主要通过槲皮素、β-谷甾醇、木犀草素等药物活性成分作用于EGFR、CAV1、MCL1等核心靶点发挥治疗作用;通过分子对接技术证明,活性成分β-谷甾醇与核心靶点MCL1密切相关。