人preproEGF的mRNA/cDNA序列中SNPs及生物信息学分布探究

摘要

目的 探明单核苷酸多态(SNPs)在人表皮生长因子前体蛋白(preproEGF)mRNA/cDNA序列中的分布状况.方法 凭借美国生物信息中心(NCBI)平台和单核苷酸多态资料库(dbSNP)检索、分析、标注和图解相关SNPs在人preproEGF多肽mRNA/cDNA序列中的分布位点和生物信息学特征.结果 分布在人肾源和其他组织源preproEGF多肽mRNMcDNA序列中的SNPs总计有106个,其中84个同位SNPs大多数以外显子6～8、11～12、16～19和22～23为间隔并集中归位于第1～5、10、13～15、20～21、24外显子序列中,另外的22个非同位SNPs大多数以密集丛簇为特征而各自分布在两类序列3'端非编码序列中,但个别例外则单独归位于肾源类序列的第9外显子中.结论 SNPs在人两类preproEGF多肽mRNA/cDNA序列中的生物信息学分布、特征和图示对于SNP与疾病或性状的相关性研究及课题设计颇具参考价值.