利用HMM算法确定重组自交系基因型

摘要

重组自交系是杂交一代经过连续自交而获得的自交系群体。隐形马尔科夫模型(HMM)是一种极大似然估计算法,在很多生物信息研究中取得了理想的结果。文章提供了利用一阶隐型马尔科夫模型来确定重组自交系个体基因型的方法,并论述了其准确性和时效性。该算法在模拟数据及小鼠基因型数据上取得了理想的结果。