反刍动物INHA基因编码区生物信息学分析

摘要

利用生物信息学的方法分析了反刍动物绵羊、水牛、藏羚羊、白犀牛、山羊的INHA基因编码序列(coding sequence,CDS),并对该基因的核苷酸歧异度、遗传分化和净遗传距离、疏水性/亲水性、蛋白质二级结构、氨基酸序列进行了分析和预测。结果表明,在反刍动物的基因序列中,核苷酸歧异度、净遗传距离大小决定了物种间亲缘关系的远近。INHA蛋白表现为疏水性,蛋白质二级结构主要结构元件是无规卷曲和延伸链,INHA蛋白呈碱性。