一种采用自适应免疫遗传算法的分子对接构象搜索方法

摘要

分子对接是计算机辅助药物分子优化设计中的重要组成部分。搜索算法和评分函数是当前分子对接研究的难点与热点。本文提出了一个基于自适应免疫遗传算法的分子对接构象搜索方法AutoDockAIGA。设计了基于自适应免疫遗传算法的构象搜索方法,运用此方法对蛋白质-配体复合物进行实验测试,实验结果与AutoDock3.05模拟退火算法和拉马克遗传算法在能量得分、对接精度和对接时间上进行对比分析,实验表明,AutoDockAIGA对接结果精确性高,收敛速度快,具有更高的寻优能力。