2007—2009年中国西南地区猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株ORF5基因遗传多样性分析

摘要

本试验旨在深入了解中国云南省猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的分子流行病学和可能的遗传变异机制,作者对2007—2009年采集的临床样本中分离的32株PRRSV分离株的ORF5基因进行测序及分析。对32株分离株与北美基因型、欧洲基因型的代表株及2个中国分离株的代表株进行核苷酸和氨基酸序列分析。试验结果表明,32株分离株与北美洲PRRSV原型株VR-2332的核苷酸同源性为86.9%～99.0%,氨基酸同源性为87.5%～98.0%;与欧洲基因型代表株Lelystad virus(LV)的同源性分别为61.7%～62.9%和54.3%～57.8%;与1996年中国大陆分离的CH-1a的同源性分别为91.2%～95.4%和90.0%～94.5%;与中国高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒代表株JX-A1的同源性分别为88.1%～99.3%和85.5%～99.0%;不同年代分离株之间的同源性分别为86.2%～99.8%和85.5%～100.0%。系统发育分析结果表明,32株PRRSV分离株均属于北美基因型,并且进一步分为2个不同的亚型。基因亚型1由分成2大分支的22株云南分离株组成;基因亚型2由与RespPRRS疫苗株及其母源株VR-2332密切相关的10个分离株组成。GP5的功能域(如信号肽、胞外域、跨膜域、胞内域)被鉴定,且已知功能的GP5蛋白的修饰(如主要中和抗原表位(PNE)和诱饵表位)也被进一步分析。研究结果表明,中国西南地区PRRSV具有巨大的基因多样性,这为预防和控制该病提供依据。