鸡Wnt3a基因组织表达差异与SNPs对鸡毛囊密度性状的遗传效应

摘要

Wnt家族成员3a(Wnt family member 3a,Wnt3a)基因是Wnt信号通路的重要成员,Wnt信号通路在动物皮肤毛囊的发生发育中具有重要作用.试验以Wnt3a为候选基因,旨在探讨鸡Wnt3a基因的组织表达差异与单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点对鸡皮肤毛囊密度性状的遗传效应.用实时荧光定量PCR检测Wnt3a基因在鸡不同组织中的表达差异;用PCR扩增直接测序法对Wnt3a基因的SNPs位点进行筛查,验证和分析不同SNPs位点基因型背部毛囊密度的差异;用实时荧光定量PCR技术检测不同品种鸡皮肤组织中Wnt3a基因mRNA表达差异.结果表明,Wnt3a mRNA在皮肤组织中表达量最高,显著高于其他组织(P＜0.05),其次是肝脏、睾丸、卵巢和下丘脑,心脏、胸肌、垂体和脾脏等组织表达量较低.在Wnt3a基因第2和3外显子区各筛选到1个SNP位点:g.2587569 G＞A和g.2555812 T＞C;在第3内含子区筛选到1个SNP位点:g.2555377 T＞C.卡方检验结果显示,3个位点均极显著偏离Hardy-Weinberg平衡.群体遗传参数分析发现,g.2555812 T＞C位点为中度多态,有效等位基因数为1.7,遗传变异程度较g.2587569 G＞A和g.2555377 T＞C位点高.SNP位点分型与毛囊密度的关联分析结果表明,g.2555377 T＞C位点CC基因型个体的毛囊密度显著高于TT和CT基因型个体(P＜0.05).在毛囊密度具有显著差异的不同品种鸡的背部皮肤组织中,Wnt3a mRNA表达差异显著(P＜0.05).该研究结果为进一步深入解析Wnt3a在鸡皮肤毛囊生长发育中的作用、筛选与毛囊密度性状相关的辅助育种标记提供了基础资料.