水貂冠状病毒中国分离株全基因序列测定及分析

摘要

为分析水貂冠状病毒中国分离株的遗传特征,采用高通量测序方法测定从山东省青岛市某养殖场分离的水貂冠状病毒基因组,首次报道了水貂冠状病毒中国分离株的全基因序列,并对其进行特性分析与比较基因组研究.结果显示:该病毒全基因组大小为28924bp,具有与其他冠状病毒相似的基因组结构和基因顺序;5'端具有帽子结构,3'端具有poly(A)尾.该分离株与19株代表性毒株的全基因组和N基因进化和同源性分析都证实,该分离株与美国分离株的同源性较高,与其余2株水貂冠状病毒和2株雪貂冠状病毒同属于冠状病毒的一个新种.