LncRNA-UCA1与淮安食管癌发病风险的初步研究

摘要

目的:初步筛选淮安食管鳞癌与癌旁组织中差异表达的Lnc RNAs,为进一步研究lnc RNAs在食管鳞癌发病机制中的作用奠定基础。方法:分别提取3例患者食管癌组织及配对癌旁组织的总RNA,体外逆转录制备并标记为双链c DNA(ds-c DNA),与人类Lnc RNA表达谱芯片进行杂交,经扫描后,用Agilent Gene Spring GX v11.5.1软件进行分析运算,筛选出差异表达的Lnc RNAs。q RT-PCR分析Lnc RNA在食管癌细胞及组织中的表达情况。结果:按照倍数≥2.0、P≤0.05的标准,筛选出表达差异有统计学意义的Lnc RNAs共1 019个,其中399个上调,620个下调。GO分析和通路分析结果显示这些Lnc RNAs调控的差异表达的m RNAs主要与细胞周期、细胞分化、蛋白酶的活动等有关。结合Gibb食管癌相关的Lnc RNA差异表达谱分析发现lnc RNA-UCA1可能参与食管癌发生发展。q RT-PCR结果显示,与永生化食管上皮细胞及癌旁组织相比,食管癌细胞及食管癌组织中lnc RNA-UCA1均表达下调。结论:共筛选出淮安食管鳞癌与癌旁组织中1 019个差异表达Lnc RNAs,其中Lnc RNAs-UCA1可能成为食管癌早期发现和诊断的生物标志物。