一例澳门手足口病病例柯萨奇病毒A6全基因组序列特征分析

摘要

目的了解1例从广西口岸入境的澳门手足口病病例的病毒基因组序列特征。方法提取待测鼻咽拭子样本的病毒RNA,采用实时荧光RT-PCR方法检测肠道病毒核酸,同时将扩增产物进行测序,通过MEGA 7.0软件使用邻位相接法构建进化树分析。结果本次澳门手足口病病例为柯萨奇病毒A组6型,与CV-A6的Gdula原型株的核苷酸同源性为81%。基因型为D3a分支,与2018年的济南株(MK357084、MK357085)、2017年的广西株(MK839021)、2017年的青岛株(MN689954)具有较高的遗传同源性。结论本研究提示,目前澳门手足口病可能以CV-A6的D3a进化分支为流行株。