内蒙古白绒山羊编码HGT-I型蛋白的特征分析

摘要

对内蒙古白绒山羊毛囊兴盛期的表达序列标签(EST)进行生物信息学方法的分析,通过在Genbank核酸数据库的Blastn相似性检索后发现有22个ESTs与小鼠的HGT protein type Ⅰ E5mRNA基因有很高的同源性,进一步地分析发现这22个ESTs可分为两种不同的序列.经ORF(开放读码框)的预测共编码2种不同的蛋白质.这2个蛋白质的氨基端和羧基端的氨基酸残基都十分得相似,其甘氨酸、酪氨酸的含量达到了71.93%,而苯丙氨酸的含量达到了10.18%.并对其进行了二级结构的预测,发现它们在二级结构上有着很高的相似性.这2个蛋白质家族成员与小鼠的HGT蛋白质在氨基酸的组成和结构上都有很高的保守性.