猴樟CbP5CR基因克隆及生物信息学分析

摘要

为研究猴樟CbP5CR蛋白的序列结构和功能,克隆猴樟CbP5CR基因CDS序列,进行生物信息学分析。结果表明,克隆得到的序列具有一个810 bp完整的ORF框,编码269个氨基酸,与沉水樟中收录的RWR74447.1基因序列一致性达98.88%,系统进化树的结果表明,猴樟CbP5CR蛋白具有较高的保守性;猴樟CbP5CR蛋白生物信息学分析结果表明,CbP5CR蛋白具有PLN02688家族结构域,CbP5CR蛋白化学分子式为C1242H2015N345O375S7,相对分子量28.01 kD,理论等电点7.03,结构稳定,不存在氨基酸无序化区域,为脂溶性和亲水性蛋白,磷酸化氨基酸位点有45个,亚细胞定位预测为细胞质。