棘孢木霉菌携带真菌病毒TaUV 1的分离与鉴定

摘要

为棘孢木霉菌株(Trichoderma asperellum)中病毒的鉴定提供参考,在棘孢木霉菌株中分离到真菌病毒Trichoderma asperellum Unassigned Virus 1(TaUV1);对其全长基因组序列进行了分析,明确真菌病毒TaUV1的病毒分类学地位.采用随机引物扩增法获得TaUV1的全长基因组序列,使用DNA-MAN、BlastP和MEGA等软件对TaUV1的全长序列进行拼接、比对和系统进化树分析.结果表明:真菌病毒TaUV1携带1条病毒条带,其基因组长度为9838 bp,GC含量为47.8.经序列分析显示,具有2个不连续的开放阅读框(Open Reading Frame,ORF),即ORF1和ORF2.ORF1长4509 bp,编码假定蛋白(Hypothetical protein,HP);ORF2长3984 bp,编码RNA依赖的RNA聚合酶(RNA dependent RNA pol-ymerase,RdRp).ORF1和ORF2之间间隔113个碱基,在ORF1终止密码子TAA的5684～5686 bp发现了1个移码序列七聚体(AAAAAAT),在此处发生了程序性-1的核糖体移码机制,使2个ORFS被通读,编码1个融合蛋白.基于TaUV1的RdRp序列进行的系统发育分析得知,TaUV1属于Unassigned Vi-rus科的新成员.