稻曲病菌菌株GZ-2中携带的病毒基因组特征

摘要

稻曲病菌是引起真菌类病害水稻稻曲病的病原.从稻曲病菌菌株GZ-2中分离到1株真菌病毒,命名为Ustilaginoidea virens Unclassified virus2(UvUV2),对其进行了序列分析.通过CF-11纤维素粉法提取菌株GZ-2中的真菌病毒UvUV2,采用随机引物扩增法获得UvUV2的全长基因组序列,使用DNAMAN、BlastP和MEGA等软件对UvUV2的全长序列进行拼接、比对和系统进化树分析.结果表明:UvUV2全基因组长度为2887 bp,GC含量为58.8％,UvUV2基因组序列中存在2个重叠的开放阅读框(ORF1和ORF2).ORF1长561 bp,编码186个氨基酸(20.06 kDa),编码1种未知蛋白;ORF2长2394 bp,编码797个氨基酸(89.42 kDa),编码依赖于RNA的RNA聚合酶.ORF2编码的蛋白与Pur-pureocillium lilacinum nonsegmented virus 1(PINV-1)RNA的RNA聚合酶关系最密切.另外,UvUV2病毒基因组序列中发现1个类似甲型流感病毒基因组中的滑动序列(CCC_UUU_UAG),使得UvUV2的ORF1和ORF2通过+1移码机制形成融合蛋白.通过UvUV2的依赖于RNA的RNA聚合酶蛋白序列构建的系统进化树分析得出,UvUV2是一种未分类的真菌病毒.综上所述,UvUV2属于一个未分类的科.