水稻SSR-PCR的反应体系优化及RIL亲本间多态性引物筛选(英文)

摘要

[目的]为比较三组概率分析法和传统QTL定位法,建立高效稳定的SSR扩增技术体系,筛选出在双亲间具有多态性的引物。[方法]本研究利用水稻Ⅱ-32B和特青两个亲本对605对均匀分布于12条染色体的SSR引物的扩增情况进行了初步筛选,并研究了其扩增多态性和最优SSR-PCR反应体系[结果]结果表明:适宜水稻的SSR-PCR反应体系(10μl)为10×Buffer 2μl,Mg2+终浓度2.0 mmol/L,dNTP终浓度0.5 mmol/L,引物终浓度1.0μmol/L,DNA模板1μl,Taq DNA聚合酶0.15U。从分布于全基因组的SSR引物中筛选出142对在双亲间具有多态性的引物。[结论]为完成后续的QTL定位研究奠定良好的基础。