高羊茅FaGF14-B和FaGF14-C基因的克隆与差异表达分析（英文）

摘要

[目的]克隆高羊茅Fa GF14-B和Fa GF14-C基因并进行基因的差异表达分析,为后续基因功能研究提供依据。[方法]以高羊茅转录组学测序获得的Fa GF14-B和Fa GF14-C基因序列片段为模板,利用3＇RACE和5＇RACE方法从高羊茅中扩增出Fa GF14-B和Fa GF14-C基因的全长c DNA序列,命名为Fa GF14-B和Fa GF14-C,并进行核酸序列分析、基因编码蛋白分析、蛋白保守结构域分析、系统进化树分析与差异表达分析。[结果]Fa GF14-B基因序列c DNA全长1 548 bp,具有完整的开放阅读框（ORF,449~1 228 bp）,编码蛋白为260个氨基酸;Fa GF14-C基因序列c DNA全长1 250 bp,具有完整的开放阅读框（ORF,66~848 bp）,编码蛋白含有261个氨基酸;GF14-B和GF14-C蛋白都具有典型的14-3-3蛋白结构域,二级结构包含9个保守的α-螺旋及不保守的N-末端和C-末端。系统进化树分析表明,高羊茅Fa GF14-B和Fa GF14-C与禾本科植物GF14蛋白具有较高的相似性,位于在同一个进化支上,亲缘关系较近;荧光定量PCR分析表明：Fa GF14-B和Fa GF14-C基因应答氮胁迫处理。[结论]该研究可为进一步筛选抗低氮胁迫相关基因、创制耐低氮的牧草新种质奠定理论基础。