河南省烟草黑胫病菌群体遗传结构的SSR分析

摘要

为明确河南省烟草黑胫病菌群体的遗传结构,本研究利用SSR分子标记对来自河南省12个地区的32株烟草黑胫病菌进行分析.结果显示,6对SSR引物共扩增出24个条带,其中多态性条带23个,多态性条带比率为95.83％;Nei's基因多样性指数和Shannon信息指数分别为0.2132和0.3356;遗传相似系数在0.61～1.00之间,相似系数0.80水平下UPGMA聚类可将32个菌株划分为5个类群,其中类群Ⅰ和类群Ⅱ包括29个菌株,为优势类群;主成分分析结果与UPGMA聚类分析结果基本一致;遗传结构分析推测河南省烟草黑胫病菌群体来自于3个祖先亚群,亚群Ⅰ、亚群Ⅱ和亚群Ⅲ在群体中所占比例分别为13.59％、46.61和39.80％;单个菌株遗传构成分析显示87.50％菌株的遗传组分几乎由单一亚群组成.以上研究结果表明河南省烟草黑胫病菌群体的遗传多样性水平较低,遗传结构也较为简单.