四指马鲅、 多鳞四指马鲅种间差异的DNA条形码分析及SCAR标记开发

摘要

在中国海域分布的马鲅科鱼类同属不同种间的外部形态特征极为相似,在形态分类上很容易混淆.本研究采用DNA条形码技术对四指马鲅(Eleutheronema tetradactylum)及其近缘种多鳞四指马鲅(Eleutheronema rhadinum)进行种间遗传差异分析.在检测的线粒体COI基因序列655 bp中,共有变异位点87个,核苷酸多样性为0.13282,序列同源性为93.34％;基于Kimura 2-parameter模型计算的种间距离为0.151(>最小物种距离0.02).结合Neighbor-joining系统树分析,四指马鲅与多鳞四指马鲅应属于同一个属亲缘关系很近的两个不同种.此外,采用10条随机引物对两种马鲅进行分析,对其中的S4随机引物扩增出约1300 bp的四指马鲅特异性条带进行SCAR转化,最终获得四指马鲅特异性SCAR标记SCAR1(目的片段469 bp,退火温度62℃)和SCAR5(目的片段606 bp,退火温度56℃),可作为四指马鲅与其近缘物种鉴定的分子标记.本研究可为马鲅鱼类的遗传背景研究和种质资源保护提供技术支撑.