甜菜夜蛾核多角体病毒基因组13.7～21.6m.u.区域的分析

摘要

甜菜夜蛾核多角体病毒(Spodopteraexiguamulticapsidnucleopolyhedrovirus,SeMNPV)基因组13 7～21 6m u 区域是SeMNPV的重组热点区。以SeMNPV美国分离株SeUS1为模板,长片段PCR对SeUS1的13 7～21 6m u 区域扩增,得到11 3kb,2 0kb和0 7kb3个片段。对照已发表的SeMNPV基因组序列,11 3kb片段是具完整SeMNPV序列基因型的产物,2 0kb和0 7kb片段表明SeUS1中还存在两种缺失突变株。对2 0kb和0 7kb片段的序列分析揭示了这两株突变株在缺失部位的DNA一级结构。对三株重组SeMNPV病毒(SeXD1、SeXD2和SeXD3)的分析发现,它们和野生型病毒SeUS1中的一个基因型一样,均缺失了SeMNPVnt18513～29105之间长10593bp的片段,暗示SeUS1中一株自发形成的缺失突变体在离体细胞中具有复制优势。将该片段基因排列与其它10种基因组序列已测定的杆状病毒比较,发现两个在GroupⅡNPVs中保守的基因簇。最大简约性法对部分基因的系统发育分析表明,缺失片段中某些基因可能存在于杆状病毒分化之前的病毒基因组中。