美国能源部资助的微生物基因组研究概况

摘要

@@ 自1995年12月完成第一个微生物(流感嗜血杆菌)全基因组测序以来[1],微生物基因组学策略和技术提高很快,促进了其他生命形式(包括人类)的基因组学发展,开创了生物基因组计划新时代[2].短短几年内,互联网数据库中各种生物基因组数据迅速增长.1998年2月20日美国Science杂志评选的当年世界十大科技进展,将微生物基因组图谱的构建列为其中第六项,同年3月27日Science杂志编者指出:生物基因组革命可以同工业革命和计算机革命所带来的变化相比,是"第三次技术革命"[3].微生物全基因组测序,不仅是人类开始得最早和首先完成的第一种生物的全基因组分析,也是迄今为止完成测序基因组种类最多的领域.美国国家能源部(DOE)和国立卫生研究院(NIH)是美国的微生物基因组计划(MGP)的启动和发展者,两个部门所关注的分别是资源微生物和病原微生物,其研究发展策略对全球MGP研究发展趋势起着决定性的影响作用.本文谨重点介绍DOE的MGP项目发展简况和资助思想.简言之,DOE认为MGP不仅是研究和应用极端环境微生物特定功能的科学基础,而且将是21世纪微生物学的信息基础[2].