广东番茄曲叶病毒G2分离物基因组DNA-A的分子特征

摘要

从采集于广东的番茄曲叶病病株上分离到病毒分离物G2,序列分析结果表明,其DNA-A为单链环状,全长2744nt,共有6个ORF,其中病毒链上编码AV1(CP)、AV2,互补链上编码AC1、AC2、AC3和AC4.BLAST结果显示,与G2基因组有同源关系的病毒均属双生病毒科菜豆金色花叶病毒属.序列比较结果显示,G2与菜豆金色花叶病毒属病毒的DNA-A序列同源率均不超过83%,其中同源率最高的是PaLCuCNV-[G10](82.8%).进一步比较发现,它们的基因间隔区(IR)变异最大(同源率为30.9%～81.8%);CP氨基酸序列的同源率较高(77.6%～99.2%),AC4蛋白氨基酸序列的同源率较低(43.5%～78.8%).系统进化关系分析结果也显示,G2与已报道的菜豆金色花叶病毒属病毒的亲缘关系均较远.因此,G2可能是双生病毒科菜豆金色花叶病毒属中一个未报道的新种,命名为广东番茄曲叶病毒(Tomato leaf curl Guangdong Virus,ToLCGDV).