高桥仁蚧线粒体全基因组测序与分析

摘要

【目的】测定和分析半翅目(Hemiptera)仁蚧科(Aclerdidae)首个线粒体全基因组——高桥仁蚧Aclerda takahashii线粒体全基因组序列,并探讨与其他蚧虫类群的系统发育关系。【方法】基于Illumina测序技术进行高桥仁蚧线粒体全基因组测序,并进行生物信息学分析;基于已报道的15科31种半翅目昆虫的线粒体全基因组序列运用最大似然法(ML)和贝叶斯推断法(BI)构建半翅目系统发育树。【结果】高桥仁蚧线粒体基因组全长16599 bp,AT含量高达84.51%。在该线粒体基因组中,缩减tRNA非常普遍,10个tRNA缺失二氢尿嘧啶(DHU)臂或TΨC臂,tRNA^(ser(S1))和tRNA^(ser(S2))缺失DHU臂和TΨC臂。系统发育树显示,与仁蚧科亲缘关系最近的是蚧科(Coccidae)。【结论】本研究报道了首个仁蚧科的线粒体基因组,发现在高桥仁蚧线粒体基因组中存在普遍的tRNA缺臂现象,为进一步系统地研究蚧虫线粒体基因组提供了数据支持。