使用组合分类器预测蛋白质相互作用

摘要

蛋白质必须通过与其他蛋白质之间的相互作用才能行使其功能,因此,对于蛋白质相互作用的研究显得尤为重要.针对蛋白质相互作用预测问题,本文提出了一种基于不同特征编码的组合分类器投票的预测方法.该方法综合考虑了蛋白质序列中氨基酸频率、氨基酸位置、氨基酸理化性质和氨基酸生物相似性等特征.在真实的蛋白质相瓦作用human数据集上,使用支持向量机根据不同特征编码建立的预测模型,分别作为组合分类器中的子分类器进行投票.结果表明,该方法能有效提高蛋白质相互作用预测的性能,且预测结果与其他方法相比也具有一定优势.