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西藏八角莲与桃儿七根及根茎SSH文库的建立

         

摘要

以西藏八角莲(Dysosma tsayuensis Ying)和桃儿七[Sinopodoph yllum hexandrum(Royle) Ying]为材料,构建其根及根茎的SSH文库,从中筛选鬼臼类植物属种间与鬼臼毒素生物合成相关的差异表达基因.从文库中随机挑取201个阳性克隆测序后得到183条ESTs.去除载体序列和冗余序列,聚类拼接得到17个西藏八角莲的unique ESTs.经BLAST同源比较和功能查寻,有功能注释的unique ESTs共12个,占70.6%,所编码的蛋白涉及光合作用、合成代谢、转录调控等功能;无功能注释和匹配结果的共5个,占29.4%.该研究成功构建了西藏八角莲和桃儿七SSH文库,为进一步揭示鬼臼毒素生物合成途径及其调控机制奠定了基础.

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