基于线粒体COⅠ基因序列的红螯螯虾养殖群体遗传结构分析

摘要

红螯螯虾原产于澳大利亚,是一种具有优良养殖前景的淡水虾类.基于线粒体COⅠ基因序列,对中国5个养殖群体的遗传多样性和结构进行评估,旨在为红螯螯虾的科学引种、良种选育和种质资源保护提供基础数据.结果显示,红螯螯虾线粒体COⅠ区全序列长1534 bp,包含24个变异位点,占分析位点的1.6％,变异位点中含有22个简约信息位点,平均转换与颠换的比值为6.14,序列中(A+T)的含量(58.7％)明显高于(G+C)的含量(41.3％),在143个个体中定义了35种单倍型,来自浙江、海南和台湾的养殖群体具有较多的共享单倍型(COⅠ-01、COⅠ-02和COⅠ-03),这3种单倍型同时也是优势单倍型.来自江苏的养殖群体的单倍型多样性最低(0.739),来自安徽的养殖群体的单倍型多样性最高(0.881).全部样本的单倍型多样性指数为0.896,核苷酸多样性指数为0.00465.5个养殖群体间的遗传距离为0.00263～0.00681,其中,来自浙江与海南的养殖群体的遗传距离最近,来自海南与安徽的养殖群体的遗传距离最远.5个养殖群体间的遗传分化系数为0.3421(P<0.01),说明5个养殖群体间存在一定程度的遗传分化.综上,5个红螯螯虾养殖群体的遗传多样性存在差异,群体间存在着一定的基因交流.研究结果可为红螯鳌虾种质资源的合理开发利用提供分子生物学依据.