基于SLAF-seq及BSA技术的甜瓜抗蔓枯病QTL定位分析

摘要

为研究甜瓜蔓枯病(GSB)抗病基因在甜瓜染色体上的定位情况,对甜瓜蔓枯病抗病亲本P181、感病亲本P01及其F2遗传分离群体进行蔓枯病抗性鉴定,根据F2蔓枯病发病情况,选择2个亲本及F2中极端抗病和极端感病的子代各30个,提取DNA并分别构建抗病和感病基因混池,利用SLAF-seq和BSA技术进行蔓枯病抗病基因QTL定位分析.测序共开发得到188022个SLAF标签,分析过滤掉低质量的SNP位点后,获得5676个高质量的SNP标记.采用SNP-index关联分析方法,在甜瓜染色体上获得2个与GSB抗性紧密关联的候选区域,一个定位于Chr01上的9837447～11028838 bp区间,区间大小为1.19 Mb;另一个定位于Chr04上的33135224～33993540 bp区间,区间大小为0.86 Mb.共有218个基因定位在关联区域内,依据基因功能注释分析,推测可能与甜瓜蔓枯病抗病相关的候选基因有15个,包括NBS-LRR基因1个,E3泛素蛋白连接酶合成基因5个,RPM1相关蛋白基因1个,锌指蛋白相关基因1个,NAC结构域蛋白基因1个,钙依赖蛋白激酶2个,凝集素相关受体蛋白基因3个,RING-H2 finger蛋白基因1个.研究结果将为甜瓜蔓枯病的抗性基因研究提供参考.