口蹄疫病毒株OA/58 3C蛋白酶的结构模拟和功能分析

摘要

以口蹄疫病毒株OA/58 RNA为模板,反转录并扩增目的cDNA,然后与pGEM-T Easy载体连接并转化JM109菌株,提取的重组质粒用凝胶电泳、PCR和EcoRⅠ酶切法鉴定.该毒株与Poliovirus,Hepatitis A virus 和 Human rhinovirus 89毒株 3C 序列对比分析发现核苷酸序列一致性分别为38.8%,37.1%和36.5%,氨基酸序列一致性分别为23.7%,19.2%和17.6% .通过Swiss-pdbViewer软件模拟出FMDV OA/58 3C蛋白酶的3D结构和表面模型.并鉴定出此毒株3C蛋白酶的活性中心为Cys31-His46-Asp84.