血、便、痰和尿标本中SARS冠状病毒核酸的检测和病毒基因谱的初步建立

摘要

目的 :利用冠状病毒全基因组芯片检测SARS患者血、便、痰和尿标本中的冠状病毒核酸并试图建立其基因谱。方法 :提取SARS患者血、便、痰和尿样本中的冠状病毒RNA ,经全基因组随机反转录和PCR扩增标记成荧光探针 ,与SARS病毒全基因组芯片进行杂交 ,同时用体外培养的病毒RNA和从健康人血液中提取的RNA做对照。结果 :SARS患者的 4种标本中都能检测到冠状病毒核酸的存在 ,与整个病毒基因组相比 ,大都为一些不连续的片断。其中尿、痰和便标本中的基因谱较为相似 ,另外 ,发现编码S1蛋白的核酸在一些标本中是连续的 ,具体为 2 3份血标本中有 2份是连续的 ,13份痰标本中有 8份是连续的 ,5 1份便标本中有 4 8份是连续的 ,2份尿标本中都是连续的。结论 :冠状病毒全基因组芯片能够检测出SARS患者血、便、痰和尿标本中的冠状病毒核酸 。