芍药属牡丹组种间关系的分子证据：GPAT基因的PCR-RFLP和序列分析

摘要

中国不仅是所有野生牡丹的原产地,也是牡丹栽培品种的起源地和发展中心.牡丹组section Moutan DC.是芍药属Paeonia L.,Paeoniaceae中惟一的木本类群.由于芍药属在被子植物中的特殊系统位置和栽培牡丹重要的经济价值,研究牡丹组的种间关系具有重要的理论和实践意义.该文对采自15个野生居群,代表牡丹组全部8个野生种的15份材料的GPAT基因片段(外显子5和6之间的内含子)进行了PCR-RFLP分析,并对代表牡丹组全部8个野生种的9份材料进行了测序.根据12个限制性内切酶的PCR-RFLP数据,使用Network(3.0)计算机程序的RM(Reduce-Medium)法建立了牡丹组种间亲缘关系网络树.同时根据8个种9份材料的GPAT基因片段序列,利用PAUP<'*>(4.0)计算机程序建立了牡丹组GPAT基因的最大简约(MP)树和邻接(NJ)树.结果获得了具有很高自展值支持、分辨良好的牡丹组种间关系(GPAT基因)树.最重要的是,该基因树所显示的牡丹组种间关系与前人根据形态学证据提出的牡丹组的种间关系基本吻合,并得到其他研究证据的支持.根据这一结果,对牡丹组种间关系进行了详细的讨论.

目录

文摘

英文文摘

第1章文献综述

1.1牡丹组sect.Mutan DC.的分类学地位及地理分布

1.2分类学研究历史

1.3种的划分、命名、地理分布和生态环境

1.4形态与分类学研究

1.5细胞学研究

1.6孢粉学研究

1.7分子标记和基因测序研究

第2章引言

2.1论文研究的目的和意义

2.2论文的主要研究内容

第3章实验材料与方法

3.1材料

3.1.1植物材料

3.1.2本研究涉及的芍药属GPAT基因的结构

3.1.3主要化学试剂

3.1.4主要仪器和设备

3.1.5常用溶液配方

3.1.6基本培养基配方

3.2实验方法

3.2.1 DNA的提取

3.2.2 PCR-RFLP

3.2.3核苷酸测序

3.2.4数据分析

第4章结果与分析

4.1 GPAT基因片段

4.2 GPAT基因酶切位点变异与牡丹组种间关系网络树

4.3 GPAT基因树与牡丹组种间关系

4.4讨论

第5章结论与建议

参考文献

附录

致谢

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