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在重组大肠杆菌中构建丙酮酸依赖的一碳代谢途径用于甲醇和甲醛合成1,3--丙二醇

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摘要

第一章绪论

1.1甲醇一碳化合物潜在的生物利用价值

1.2甲醇生物利用的研究

1.3甲醛代谢途径的研究

1.3.1甲醛异化途径—谷胱甘肽(GSH)依赖的甲醛脱毒途径

1.3.2甲醛同化途径-核酮糖单磷酸途径(RuMP)及其应用

1.4醛缩酶的研究进展及其潜在的生物应用价值

1.5 1,3-丙二醇简介及其合成方法

1.6生物法合成1,3-丙二醇的研究进展

1.7本论文研究思路及研究意义

第二章挖掘具有潜在应用价值的醛缩酶用于甲醛固定

2.1引言

2.2实验试剂与仪器

2.2.1实验试剂的配制

2.2.2实验菌株与质粒

2.2.3实验引物

2.3实验方法

2.3.1数据库及分析软件

2.3.2大肠杆菌TOP10和BL21(DE3)感受态细胞的制备

2.3.3胶回收

2.3.4质粒提取

2.3.5目的基因的获取

2.3.6重组质粒的构建

2.3.7 alac基因的定点突变

2.3.8表达和克隆菌株的构建

2.3.9菌株培养条件及基因的诱导表达

2.3.10 2-氧代-4-羟基丁酸的定性和定量

2.3.11分析方法

2.3.12醛缩酶的酶活测定

2.3.13蛋白纯化及其步骤

2.3.14分析方法

2.3.15 KHB的Km值测定方法

2.3.16 KHB的甲醛耐受性研究

2.4实验结果与讨论

2.4.1 2-氧代-4-羟基丁酸的制备,定性和定量

2.4.2重组质粒的构建

2.4.3醛缩酶的蛋白表达及酶活力的测定

2.4.4 KHB的纯化

2.4.5 KHB的Km值测定

2.4.6 KHB的甲醛耐受性

2.5本章小结

第三章甲醛和丙酮酸体外合成1,3-丙二醇

3.1引言

3.2实验材料与仪器

3.2.1实验菌株和质粒

3.2.2实验引物

3.3实验方法

3.3.1目的基因的获取

3.3.2重组质粒的构建

3.3.3菌株培养条件及基因的诱导表达

3.3.4由甲醛和丙酮酸体外生产1,3-PDO

3.3.5 KDC的酶活测定

3.3.6分析方法

3.4实验结果与讨论

3.4.1重组质粒的构建

3.4.2菌株E.coli-kdc和E.coli-dhat的蛋白表达

3.4.3由甲醛和丙酮酸体外合成1,3-PDO

3.4.4 KDC的酶活测定

3.5本章小结

第四章构建丙酮酸依赖的一碳代谢途径用于体内生产1,3-丙二醇

4.1引言

4.2代谢途径的分析

4.3实验材料与仪器

4.3.1实验菌株与质粒

4.3.2实验引物

4.4实验方法

4.4.1目的基因的获取

4.4.2新1,3-PDO生物合成途径的构建

4.4.3菌株培养条件及基因的诱导表达

4.5实验结果与讨论

4.5.1重组质粒的构建

4.5.2重组菌株BP3和BP4的蛋白表达

4.6本章小结

第五章甲醇或甲醛和葡萄糖体内合成1,3-丙二醇

5.1引言

5.2实验材料与仪器

5.3实验菌株和质粒

5.4实验方法

5.4.1批次发酵和补料批次发酵方法

5.5实验结果与讨论

5.5.1 BP3批次发酵和补料批次发酵合成1,3-PDO

5.5.2 BP4补料批次发酵合成1,3-PDO

5.6本章小结

第六章代谢途径的优化

6.1引言

6.2实验材料与仪器

6.2.1实验菌株与质粒

6.2.2实验引物

6.3实验方法

6.3.2大肠杆菌CRISPR-Cas9操作说明

6.3.4 pGRB-sg-frmA质粒构建

6.3.5构建donor dsDNA

6.3.7 pGRB-sg-frmA质粒和donor dsDNA电转入E.coli BL21(DE3)-pREDCas9

6.3.8消除pGRB-sg-frmA质粒

6.3.9消除pREDCas9质粒

6.3.10制备E.coli BL21(DE3)ΔfrmA感受态

6.3.11补料批次发酵方法

6.4.1构建E.coli BL21(DE3)ΔfrmA菌株

6.4.2补料批次发酵合成1,3-PDO

6.4.3利用13C-甲醛同位素标记物验证代谢途径的可行性

6.5本章小结

第七章结论与展望

7.1论文主要结论

7.2展望

参考文献

附录

致谢

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