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摘要
第一章绪论
1.1甲醇一碳化合物潜在的生物利用价值
1.2甲醇生物利用的研究
1.3甲醛代谢途径的研究
1.3.1甲醛异化途径—谷胱甘肽(GSH)依赖的甲醛脱毒途径
1.3.2甲醛同化途径-核酮糖单磷酸途径(RuMP)及其应用
1.4醛缩酶的研究进展及其潜在的生物应用价值
1.5 1,3-丙二醇简介及其合成方法
1.6生物法合成1,3-丙二醇的研究进展
1.7本论文研究思路及研究意义
第二章挖掘具有潜在应用价值的醛缩酶用于甲醛固定
2.1引言
2.2实验试剂与仪器
2.2.1实验试剂的配制
2.2.2实验菌株与质粒
2.2.3实验引物
2.3实验方法
2.3.1数据库及分析软件
2.3.2大肠杆菌TOP10和BL21(DE3)感受态细胞的制备
2.3.3胶回收
2.3.4质粒提取
2.3.5目的基因的获取
2.3.6重组质粒的构建
2.3.7 alac基因的定点突变
2.3.8表达和克隆菌株的构建
2.3.9菌株培养条件及基因的诱导表达
2.3.10 2-氧代-4-羟基丁酸的定性和定量
2.3.11分析方法
2.3.12醛缩酶的酶活测定
2.3.13蛋白纯化及其步骤
2.3.14分析方法
2.3.15 KHB的Km值测定方法
2.3.16 KHB的甲醛耐受性研究
2.4实验结果与讨论
2.4.1 2-氧代-4-羟基丁酸的制备,定性和定量
2.4.2重组质粒的构建
2.4.3醛缩酶的蛋白表达及酶活力的测定
2.4.4 KHB的纯化
2.4.5 KHB的Km值测定
2.4.6 KHB的甲醛耐受性
2.5本章小结
第三章甲醛和丙酮酸体外合成1,3-丙二醇
3.1引言
3.2实验材料与仪器
3.2.1实验菌株和质粒
3.2.2实验引物
3.3实验方法
3.3.1目的基因的获取
3.3.2重组质粒的构建
3.3.3菌株培养条件及基因的诱导表达
3.3.4由甲醛和丙酮酸体外生产1,3-PDO
3.3.5 KDC的酶活测定
3.3.6分析方法
3.4实验结果与讨论
3.4.1重组质粒的构建
3.4.2菌株E.coli-kdc和E.coli-dhat的蛋白表达
3.4.3由甲醛和丙酮酸体外合成1,3-PDO
3.4.4 KDC的酶活测定
3.5本章小结
第四章构建丙酮酸依赖的一碳代谢途径用于体内生产1,3-丙二醇
4.1引言
4.2代谢途径的分析
4.3实验材料与仪器
4.3.1实验菌株与质粒
4.3.2实验引物
4.4实验方法
4.4.1目的基因的获取
4.4.2新1,3-PDO生物合成途径的构建
4.4.3菌株培养条件及基因的诱导表达
4.5实验结果与讨论
4.5.1重组质粒的构建
4.5.2重组菌株BP3和BP4的蛋白表达
4.6本章小结
第五章甲醇或甲醛和葡萄糖体内合成1,3-丙二醇
5.1引言
5.2实验材料与仪器
5.3实验菌株和质粒
5.4实验方法
5.4.1批次发酵和补料批次发酵方法
5.5实验结果与讨论
5.5.1 BP3批次发酵和补料批次发酵合成1,3-PDO
5.5.2 BP4补料批次发酵合成1,3-PDO
5.6本章小结
第六章代谢途径的优化
6.1引言
6.2实验材料与仪器
6.2.1实验菌株与质粒
6.2.2实验引物
6.3实验方法
6.3.2大肠杆菌CRISPR-Cas9操作说明
6.3.4 pGRB-sg-frmA质粒构建
6.3.5构建donor dsDNA
6.3.7 pGRB-sg-frmA质粒和donor dsDNA电转入E.coli BL21(DE3)-pREDCas9
6.3.8消除pGRB-sg-frmA质粒
6.3.9消除pREDCas9质粒
6.3.10制备E.coli BL21(DE3)ΔfrmA感受态
6.3.11补料批次发酵方法
6.4.1构建E.coli BL21(DE3)ΔfrmA菌株
6.4.2补料批次发酵合成1,3-PDO
6.4.3利用13C-甲醛同位素标记物验证代谢途径的可行性
6.5本章小结
第七章结论与展望
7.1论文主要结论
7.2展望
参考文献
附录
致谢
导师和作者简介
研究成果及发表的学术论文