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人巨噬细胞的起源与特化

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摘要

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第一章研究背景及意义

第二章材料与方法

2.2单细胞悬液制备及流式分选

2.3 YSMP的体外培养

2.4单细胞转录组建库及测序

2.5单细胞转录组测序数据的预处理

2.6细胞群体认定和降维展示

2.7 SCENIC和GSEA分析

2.7假时序分析

2.8 YSMP特征基因的鉴定

2.9差异表达基因和群体标记基因的鉴定

2.10原始数据和分析代码

3.1结果

3.1.1入组标本及测序质量控制

3.1.2人胚期造血全景图

3.1.3 YSMP的表型预测及体外分化潜能验证

3.1.4人胚期造血祖细胞分子特征和动力学变化

3.1.5 YSMP在胚肝中的发育路径

3.1.6人巨噬细胞的多重起源

3.1.7小胶质细胞的起源和特化

3.1.8人胚头、肺、肝脏及皮肤中巨噬细胞特征

3.1.9人胚期与成体TRM特征对比

3.2讨论

致谢

参考文献

个人简历

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摘要

巨噬细胞是人胚发育过程中最早出现的一类免疫细胞(受孕后第3周)。巨噬细胞作为一种经典的固有免疫细胞,通过吞噬和抗原提呈作用构成了人固有免疫系统。在小鼠研究中发现,胚胎卵黄囊(yolk sac,YS)起源的巨噬细胞可进入多种组织器官,并在微环境的作用下分化成不同的组织驻留型巨噬细胞(tissue-resident macrophage,TRM)。然而对于人类胚胎中巨噬细胞的起源和特化的认识,目前仍然是极其有限。在此,我们从卡内基分期(Carnegie stage,CS)11至23的人胎中流式分选出CD45+造血细胞,并通过单细胞转录组测序绘制了人胚期造血细胞的全景图。该研究利用单细胞转录组测序技术精准解析了人胚期(孕8周内)巨噬细胞发育过程:明确了人胚巨噬细胞的多重起源;结合转录组、免疫表型和功能三个层面定义了人胚第一个具有多系分化潜能的造血祖细胞群体(yolk sac-derived myeloid-biased progenitor, YSMP);解析了组织驻留型巨噬细胞特化过程中的关键分子特征。最后,我们还比较了胚胎期和出生后TRM之间的相似和不同之处。总之,这些发现可为巨噬细胞发育及巨噬细胞相关疾病的研究提供重要的基础数据。

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