声明
第 1 章 绪论
1.1引言
1.2 蛋白质结构
1.3 蛋白质结构数据库
(1)PDB数据库
(2)HSSP数据库
(3)CATH数据库
(4)SCOP数据库
1.4 蛋白质结构预测
1.5 广义溶剂化自由能
1.6 本章小结
第 2 章 分类器设计
2.1 引言
2.2 神经网络
2.2.1 激活函数
2.2.2 损失函数
2.2.3 随机梯度下降
2.3 Softmax
2.4 Hierarchical softmax
2.4.1 哈夫曼树和哈夫曼编码
2.4.2 Hierarchical softmax 算法
2.5 神经网络性能评价
2.6 本章小结
第 3 章 数据处理及模型训练
3.1 引言
3.2 特征提取
3.2.1 单个氨基酸特征提取
3.2.2 氨基酸二体特征提取
3.2.3 氨基酸三体特征提取
3.3 模型搭建
3.3.1 二体预测模型
3.3.2 三体预测模型
3.4 本章小结
第 4 章 结果与讨论
4.1 原始数据集
4.2 单个氨基酸特征提取结果
4.3 氨基酸二体模型训练结果
4.4 氨基酸三体模型训练结果
4.5本章小结
第 5 章 结论
参考文献
作者简介
致谢
吉林大学;