鲤、鲫复制Sox10基因的表达和功能分化研究

摘要

锦鲤(Cyprinus carpio var.koi)隶属鲤形目、鲤科、鲤属，为鲤的变种，是人们对自然鱼种进行杂交选育而形成的。因其姿态雍容华贵、色彩绚丽，而风靡全球。红白锦鲤作为体色鱼类的一个典型代表，具有非常重要的研究意义。本论文以红白锦鲤和红白彩鲫为研究材料，在实验室前期的研究工作基础上，对复制Sox10基因在红白体色的表达和功能分化进行研究　　为探明锦鲤复制 Sox10基因在红白体色的表达和功能分化，采用 PCR技术获得 Sox10基因的全长 cDNA序列分别命名为 Sox10a和 Sox10b。Sox10a基因 cDNA总长度为3221 bp，其中5’UTR310 bp、3’UTR1432 bp，开放阅读框1446 bp（编码481个氨基酸）。Sox10b基因 cDNA总长度为3167 bp。其中5’UTR为308 bp、3’UTR为1346 bp，开放阅读框1452 bp（编码483个氨基酸）。红白锦鲤Sox10基因的氨基酸序列与其他部分物种的相似性在43%--94%之间。RT-PCR分析显示，Sox10a、Sox10b基因在红白锦鲤皮肤、眼和脑表达量最高，鳞、鳍、鳃、肌、肠、心次之，肝和肾几乎不表达。在皮、脑、眼、鳞、鳍、鳃、肌、肠、心、肝、肾中 Sox10a、Sox0b表达量依次降低，且 Sox10a的表达量在各个组织中高于 Sox10b。在红皮、白皮、红鳞、白鳞中， Sox10a的表达量高于 Sox10b。Sox10a、Sox10b在白皮、红皮、白鳞、红鳞中的表达量分别是白皮高于红皮，白鳞高于红鳞。结果发现，锦鲤存在复制复制 Sox10基因，二者序列发生变化，并且在红白体色有差异。　　为探明彩鲫（Carassius auratus）复制 Sox10基因在红白体色的表达和功能分化，采用PCR技术获得 Sox10基因的全长cDNA序列，分别命名为Sox10a和Sox10b。Sox10a基因 cDNA总长度为3450 bp。其中5’UTR为282 bp和3’ UTR为1728 bp，开放阅读框为1440 bp（编码480个氨基酸）。Sox10b基因cDNA总长度为3109 bp。5’UTR为295 bp和3’ UTR为1365 bp，开放阅读框为1449 bp（编码483个氨基酸）。红白彩鲫的复制 Sox10氨基酸序列与其他部分物种的相似性在43%--92%之间。荧光定量 PCR分析显示，Sox10a、Sox10b基因在红白彩鲫脑和肌表达量最高，眼、皮、鳞、鳍、鳃、心、肠、次之，肝和肾几乎不表达。在脑、肌、眼、皮、鳞、鳍、鳃、心、肠、心、肝、肾中Sox10a、Sox0b表达量依次降低，且Sox10a的表达量在各个组织中高于Sox10b。在红皮、白皮、红鳞、白鳞中，Sox10a的表达量高于 Sox10b。Sox10a、Sox10b在白皮、红皮、白鳞、红鳞中的表达量分别是白皮高于红皮，白鳞高于红鳞。结果发现，彩鲫的 Sox10基因存在两份拷贝，并且在红白彩鲫的红白体色有表达和变化。

目录

声明

第一章 前 言1

1.1 锦鲤的起源和介绍

1.2鱼类体色的研究进展

1.3 Sox基因概述

1.4 本论文的主要研究路线

第二章 红白锦鲤Sox10基因的克隆与表达分析

2.1材料、仪器

2.2实验方法及实验结果

2.3实验结果

2.4 生物学信息分析

2.5 实时荧光定量 PCR 分析

2.6 结果分析

2.7 Sox10a和Sox10b的组织表达和红白皮肤之间的表达差异

2.8 讨论

第三章 红白彩鲫Sox10基因的克隆与表达分析

3.1实验材料

3.2 实验试剂

3.3 主要仪器

3.4 实验方法

3.5生物学信息分析

3.6 实时荧光定量PCR分析

3.7结果分析

3.8 讨论

第四章 其他研究内容（大理裂腹鱼线粒体基因组的测序与分析）

4.1 大理裂腹鱼简介

4.2 线粒体

4.3大理裂腹鱼线粒体基因组的扩增

4.4 系统发育关系分析

4.5 小结

参考文献

致谢

在读期间发表的学术论文及研究成果