贵阳常见嗜尸性蝇类生活史和蛹期转录组学研究

摘要

目的：　　观察贵阳地区夏季瘦叶带绿蝇（Hemipyrellia ligurriens）、厩腐蝇（Muscina stabulans）、台湾别麻蝇（Boettcherisca formosensis）在室内自然条件下生活史与积温的关系；探讨棕尾别麻蝇（Boettcherisca peregrine）蛹3个不同发育时间转录组的差异表达，为进一步探究棕尾别麻蝇蛹各个时间转录组中的差异基因提供实验数据。　　方法：　　1.于贵州医科大学和贵州警官职业学院两地，分别放置家兔尸体诱捕台湾别麻蝇、厩腐蝇、瘦叶带绿蝇3种嗜尸性蝇类进行饲养直至产卵，观察3种嗜尸性蝇类在贵阳地区夏季自然条件下各发育阶段的历期并记录温、湿度。2.于贵州医科大学室外放置实验用家兔尸体，采集棕尾别麻蝇进行人工饲养。待其产下幼虫至化蛹后，每24 h收集一次蝇蛹，每次2粒，直至羽化出成虫，选取第1、5、10天收集的蝇蛹，提取总RNA测序进行文库构建，使用软件edgeR对基因差异表达进行分析，筛选差异基因做实时荧光定量验证，对已知基因（Unigene）进行京都数据库（KEGG）代谢通路分析，使用MISA对Unigene进行简单重复序列(SSR)检测。　　结果：　　1.台湾别麻蝇6月、7月、8月发育历期为17.00d、15.19d、15.7d；厩腐蝇6月、7月发育历期为16.13d、13.9d；瘦叶带绿蝇7月发育历为13.06d。其中厩腐蝇与瘦叶带绿蝇在7月发育历期相似；厩腐蝇6月、7月发育历期时间和台湾别麻蝇6月与7月、8月发育历期有差异。统计出3种嗜尸性蝇类的发育总历期和积温的基础数据。2.获得各分组样品基因组表达水平，共捕获38727条Unigenes，将不同时间的蝇蛹转录组结果构建数据库进行两两比较，差异基因总数为5283，将差异表达基因进行可视化散点图和火山图构建以及模式聚类构建，对差异基因GO分类统计和富集分析并将差异性明显的酪氨酸羟化酶（TH）基因与CBM-14基因筛选出来做实时荧光定量与测序结果一致。棕尾别麻蝇蛹转录组共有8856个 Unigene被注释，被注释的代谢通路有336个。SSR查找发现，从Unigene中共查找到SSR位点占总比例的22.32%。其中，单核苷酸重复所占比例最高，其次是三核苷酸重复。SSR不同重复基元类型中，出现频率最高的为A/T，其次是AAC/GTT，AC/GT。　　结论：　　1.厩腐蝇、台湾别麻蝇、瘦叶带绿蝇的发育历期与温度变化有关，并获得三种嗜尸性蝇类的生活史数据。2.构建贵阳地区棕尾别麻蝇蛹3个不同发育时间的转录组数据库，用于寻找差异基因。3.TH基因与CBM-14基因在棕尾别麻蝇蛹的三个不同发育时间表达有显著差异。

目录

声明

英文缩略词表

0引 言

一、通过研究嗜尸性蝇类生活史及形态学上的变化推断死后间隔时间。

二、通过发育历期及有效积温推断

1材料与方法

1.1材料

1.2方法

2 结 果

2.1 台湾别麻蝇、厩腐蝇、瘦叶带绿蝇生活史结果

2.2棕尾别麻蝇蛹转录组测序及差异基因表达结果

3 讨 论

3.1 贵阳地区台湾别麻蝇、厩腐蝇、瘦叶带绿蝇生活史研究

3.2 棕尾别麻蝇蛹3个发育时期的转录组差异研究

4结论

5创新点

参考文献

综述：嗜尸性蝇类的法医学运用研究现状及进展

作者简历

致谢

学位论文数据集