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文献综述
1反刍动物瘤胃及瘤胃微生物
1.1反刍动物瘤胃
1.2瘤胃微生物
1.3瘤胃微生物的分布
1.4瘤胃纤毛虫与其他微生物的相互关系
1.5瘤胃纤毛虫的主要作用
1.6影响瘤胃纤毛虫数量及种群的因素
2基于核糖体RNA的分子生物学技术在瘤胃微生物研究中的应用
2.1基于核糖体RNA为主的分子生物学技术的基本原理
2.2利用16S rRNA研究瘤胃细菌群体结构及进化关系
2.3利用18S rRNA研究瘤胃纤毛虫群体结构及进化关系
3 PCR-DGGE技术研究瘤胃微生物区系的多样性
3.1 PCR技术的基本原理
3.2 DGGE技术的基本原理
3.3 PCR-DGGE技术的优缺点
3.4 PCR-DGGE技术在瘤胃微生物多样性研究中的应用
4问题与展望
5本研究的主要内容
第一章瘤胃微生物总DNA的提取与检测
1.1实验材料
1.1.1仪器
1.1.2试剂
1.1.3溶液的配制
1.2实验方法
1.2.1瘤胃内容物的采集与处理
1.2.2样品总DNA的提取
1.2.3 DNA提取质量检测
1.2.4琼脂糖凝胶电泳检测
1.3结果与分析
1.3.1 DNA电泳结果
1.3.2 DNA扩增效果检测结果
1.4讨论
1.5小结
第二章含GC发夹引物PCR扩增方法的优化
2.1实验材料
2.1.1仪器
2.1.2试剂
2.1.3溶液的配制
2.2实验方法
2.2.1常规PCR扩增
2.2.2降落式PCR
2.2.3复原条件PCR
2.2.4琼脂糖凝胶电泳检测
2.3结果与分析
2.3.1常规PCR扩增结果
2.3.2降落式PCR扩增结果
2.3.3复原条件PCR扩增结果
2.4讨论
2.5小结
第三章水牛瘤胃纤毛虫群落多样性的DGGE分析
3.1实验材料
3.1.1仪器
3.1.2试剂
3.1.3溶液的配制
3.2实验方法
3.2.1 DGGE电泳变性剂溶液的配制
3.2.2 DGGE电泳胶的制备
3.2.3 DGGE电泳
3.2.4染色
3.2.5部分优势条带的回收与序列分析
3.2.6 DGGE图谱相似性分析
3.3结果与分析
3.3.1 DGGE分离结果
3.3.2 DGGE指纹图谱聚类分析
3.3.3部分优势条带的序列分析
3.4讨论
3.5小结
第四章全文结论
参考文献
附录 水牛瘤胃优势纤毛虫的18S rRNA测序序列
致谢
攻读学位期间发表论文情况
广西大学;