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摘要
英文缩写索引
引言
第一章文献综述
1二花脸猪
1．1二花脸猪的地理分布及品种形成史
1．2二花脸猪的种质特性
2影响产仔数的生理途径
2．1激素的水平
2．2性腺及相关组织器官的生长发育
2．3子宫内环境
3产仔数相关生理指标的影响因素
3．1非遗传因素
3．2遗传因素
4经济性状相关基因定位策略的研究进展
4．1基因定位使用的分子标记
4．2SNP标记的常用检测方法
4．3基因定位使用的生物信息学手段
4．4基因定位结果在实际生产中的应用
5二花脸猪产仔数相关的遗传学研究进展
5．1已知候选基因的验证
5．2QTL定位及候选基因的鉴别
6本研究的目的和意义
第二章二花脸猪产仔数变异及高低产母猪生理差异分析
1材料与方法
1．1试验材料
1．2试验方法
1．3统计方法
2结果与分析
2．1二花脸猪产仔数变异
2．2极端高低产母猪子宫发育水平的比较
2．3极端高低产母猪子宫冲洗液中Ca2+含量差异
3讨论
4本章小结
第三章极端高低产二花脸母猪及子代子宫发育水平的生理差异
1材料与方法
1．1试验材料
1．2试验方法
1．3统计方法
2结果与分析
2．1二花脸猪产仔数变异
2．2配种后第24d高、低产母猪相关指标分析
2．3高、低产母猪不同日龄子代子宫发育水平比较
3讨论
4本章小结
第四章基于极端高低产二花脸母猪子宫内膜基因差异表达分析鉴别影响二花脸猪品种内产仔数变异关键基因
1材料与方法
1．1试验材料
1．2试验方法
1．3统计方法
2结果与分析
2．1试验样本表型信息
2．2转录组数据概况
2．3差异表达基因
2．4差异表达基因的GO和KEGG富集分析
2．5qRT-PCR验证结果
3讨论
4本章小结
第五章基于极端高低产二花脸母猪全基因组关联分析鉴别影响二花脸猪品种内产仔数变异QTL和候选基因
1材料与方法
1．1试验材料
1．2试验方法
1．3统计方法
2结果与分析
2．1GWAS样本的表型概况
2．2SNP数据质控
2．3GWAS结果
2．4QTL及候选基因定位
2．5验证候选位点
3讨论
4本章小结
第六章猪13号染色体产仔数相关QTL目标区域精细定位与关键基因鉴别
1材料与方法
1．1试验材料
1．2试验方法
1．3精细定位QTL区间的确定
1．4精细定位QTL区间内候选基因鉴别
1．5统计方法
2结果与分析
2．1二花脸猪和梅山猪的产仔数概况
2．2全基因组重测序概况
2．3目标区域SNP的挑选
2．4SNP与产仔数性状的关联分析
2．5SNP与产仔数性状的LDLA分析
2．6二花脸猪和梅山猪群体的Meta分析
2．7影响产仔数性状QTL的精细定位及候选基因鉴别
3讨论
4本章小结
全文总结
参考文献
本文创新点及有待进一步研究的问题
致谢
攻读博士学位期间研究成果
附录
南京农业大学;
