声明
摘要
缩略语表
1前言
1．1哲罗鲑简介
1．2转录组研究
1．3遗传连锁图谱构建
1．4种质特异性标记
1．5性别特异性标记
1．6研究的目的与意义
2材料与方法
2．1主要仪器和试剂
2．1．1主要仪器
2．1．2主要试剂及试剂盒
2．1．3常用试剂配制
2．2转录组分析材料与方法
2．2．3转录组序列拼接
2．2．4转录组装配评估
2．2．5转录组注释
2．2．7SSR和SNP分析
2．3遗传连锁图谱构建试验材料与方法
2．3．3序列处理
2．3．4连锁图谱构建
2．3．5QTL分析
2．4种质特异性标记试验材料与方法
2．4．2哲罗鲑和细鳞鲑种质its1基因鉴定
2．4．3哲罗鲑、细鳞鲑和杂交种SSR标记鉴定
2．5性别特异性标记试验材料与方法
2．5．1试验材料
2．5．2引物设计及鉴定
3结果与分析
3．1转录组资源开发
3．1．1转录组装配
3．1．2哲罗鲑转录组注释
3．1．3同源基因分析
3．1．4同源基因簇分析
3．1．5系统发育分析
3．1．6正向选择分析
3．1．7cDNA-SSR
3．1．8SNP
3．2遗传连锁图谱构建
3．2．1序列统计分析
3．2．2连锁图谱的构建
3．2．3连锁图谱的评估
3．2．4生长性状QTL定位
3．2．5生长性状候选基因的筛选
3．3种质鉴定标记筛选
3．3．1哲罗鲑和细鳞鲑种质its1基因鉴定
3．3．2哲罗鲑、细鳞鲑和杂交种SSR标记鉴定
3．4性别特异性标记开发
3．4．1引物筛选
3．4．2PCR引物浓度优化
3．4．3性别特异性标记鉴定
3．4．4性别特异性标记在野生群体性比分析中的应用
4讨论
4．1哲罗鲑转录组研究
4．1．2比较转录组分析
4．2遗传连锁图谱构建
4．3种质特异性标记筛选
4．4性别特异性标记筛选
4．5特异性标记在野生种群中的应用
5结论
致谢
参考文献
附录
攻读博士学位期间发表的学术论文
东北农业大学;
