灵芝免疫调节蛋白突变体与EGFR相互作用的理论计算研究

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第一章 绪论

1.1 灵芝免疫调节蛋白

1.1.1 灵芝免疫调节蛋白

1.1.2 灵芝免疫调节蛋白突变体及其与表皮生长因子受体相互作用

1.2 表皮生长因子受体研究现状

1.2.1 表皮生长因子受体简介

1.2.2 EGFR跨膜区二聚化抑制剂的研究前景

1.3 以EGFR为治疗靶点的肿瘤药物发展

1.3.1 单克隆抗体（MAb）

1.3.2 小分子酪氨酸激酶抑制剂（TKI）

1.4 分子对接（Molecular Docking）

1.4.1 分子对接定义与方法

1.4.2 对接程序

1.5 分子动力学模拟

1.5.1 分子动力学模拟的理论研究

1.5.2 分子动力学模拟的应用

1.6 本文主要研究内容及其意义

第二章 EGFR跨膜结构域在模式生物膜中的变构研究及跨膜结构域二聚化抑制剂的虚拟筛选

2.1 引言

2.2 实验材料

2.3 理论方法

2.3.1 确定EGFR跨膜结构域氨基酸序列

2.3.2 构建EGFR跨膜结构域结构模型

2.3.3 EGFR跨膜结构域二聚化形态研究

2.3.4 EGFR跨膜结构域二聚化抑制剂筛选

2.4 实验结果

2.4.1 EGFR跨膜区结构域序列

2.4.2 EGFR跨膜结构域稳定性研究

2.4.3 EGFR跨膜结构域二聚化形态研究

2.4.4 EGFR 跨膜结构域二聚化抑制剂筛选结果

2.5 总结与讨论

第三章 灵芝免疫调节蛋白突变体与EGFR结合姿态的实验研究和分子动力学计算

3.1 引言

3.2 实验材料

3.2.1 实验仪器

3.2.2 实验试剂

3.2.3 EGFR与灵芝免疫调节蛋白突变体的三维结构及分子动力学软件

3.3 理论方法

3.3.1 EGFR胞外域和灵芝免疫调节蛋白突变体的化学交联结合质谱

3.3.2 等温量热滴定（ITC）实验

3.3.3 灵芝免疫调节蛋白突变体与EGFR分子对接计算

3.3.4 灵芝免疫调节蛋白突变体与EGFR分子动力学模拟计算

3.4 实验结果

3.4.1 EGFR胞外域和灵芝免疫调节蛋白突变体的化学交联结合质谱

3.4.2 等温量热滴定（ITC）实验

3.4.3 灵芝免疫调节蛋白突变体与EGFR分子对接

3.4.4 灵芝免疫调节蛋白突变体与EGFR分子动力学模拟

3.5 总结与讨论

第四章 结论

参考文献

致谢