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肝细胞癌中AFP相关N-糖蛋白质组的异质性研究

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第一章 绪论

1.1 肝细胞癌的概述

1.1.1 肝细胞癌的基本介绍

1.1.2 肝细胞癌的早期检测

1.2 肝细胞癌相关糖组学研究进展

1.2.1 蛋白质糖基化

1.2.2 肝细胞癌相关蛋白糖基化研究

1.3 糖蛋白质组学研究方法

1.4 研究目的、内容及意义

第二章 TMT-标记完整N-糖肽的富集和质谱分析方法在肝细胞癌中的应用

2.1 引言

2.2 材料与仪器

2.2.1 试剂及耗材

2.2.2 主要仪器

2.3 实验方法

2.3.1 组织样本收集

2.3.1 蛋白提取与酶解

2.3.2 TMT标记多肽

2.3.3 混合阴离子交换萃取柱富集N-连接的糖肽

2.3.4 LC-MS/MS 分析

2.3.5 N-连接完整糖肽的鉴定

2.4 实验结果

2.4.1 蛋白提取结果

2.4.2 N-连接完整糖肽富集结果

2.4.3 TMT-标记多肽的效率

2.4.4 HCC 组织N-连接完整糖肽鉴定结果

2.5 小结

第三章 低与高浓度AFP 的HCC 组织中位点特异性糖基化异质性研究

3.1 引言

3.2 试剂与仪器

3.2.1 试剂及耗材

3.2.2 主要仪器

3.3 实验方法

3.3.1组织样本收集

3.3.2完整糖肽的定量分析

3.3.3 数据分析

3.4 实验结果

3.4.1 HCC 中位点特异性糖基化的定量结果

3.4.2 低和高AFP HCC 中共同发生改变的位点特异性糖基化分析

3.4.3 低与高AFP HCC 组织中位点特异性糖基化的异质性分析

3.5 小结

第四章 低与高浓度AFP 的HCC 血清中位点特异性糖基化异质性研究

4.1 引言

4.2 试剂与仪器

4.3 实验方法

4.3.1 血清样本的收集

4.3.2 样本的预处理

4.3.3 LC-MS/MS 分析

4.3.4数据分析

4.4 实验结果

4.4.1 肝细胞癌血清中位点特异性N-糖基化鉴定结果

4.4.2 HCC 血清中位点特异性糖基化的定量结果

4.4.3 AFP 阴性肝细胞癌患者血清中的潜在生物标志物

4.4.4 HCC 血清中共同发生变化的位点特异性糖基化分析结果

4.4.5 低和高AFP 浓度的HCC 血清中位点特异性糖基化的异质性分析

4.4.6 低和高AFP 浓度的HCC 血清与组织中位点特异性糖基化的对比

4.5 小结

全文总结及展望

参考文献

致谢

攻读硕士学位期间取得的科研成果

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著录项

  • 作者

    赵婷;

  • 作者单位

    西北大学;

  • 授予单位 西北大学;
  • 学科 生物工程
  • 授予学位 硕士
  • 导师姓名 孙士生;
  • 年度 2020
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 TH6TG1;
  • 关键词

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