刚竹属竹种IRAP分子标记的开发与应用

目录

引言

1 文献综述

1.1竹亚科反转录转座子研究进展

1.2.1反转录转座子的类型

1.2.2反转录转座子的结构

1.2.3反转录转座子的分布

1.2.4反转录转座子高拷贝性

1.2.5反转录转座子高异质性和表达

1.2.6反转录转座子对基因组的影响

1.3.1基于反转录转座子分子标记的种类和原理

1.3.2基于反转录转座子分子标记在植物遗传育种中应用

1.3.3 DNA分子标记在刚竹属遗传多样分析上应用

1.4本研究的目的和意义

2用于IRAP分子标记的LTR反转录转座子筛选

2.1实验方法

2.1.1 LTR反转录转座子的鉴定

2.1.2 LTR序列相似分析

2.2.2 毛竹反转录转座子的LTR序列相似分析

2.2.3 用于IRAP分子标记开发的候选Cluster的筛选

2.2.4 13个Cluster中LTR反转录转座子的结构特性分析

2.2.5 13个Cluster中LTR反转录转座子插入时间分析

2.3讨论

3 IRAP分子标记引物设计和选择

3.1材料

3.2方法

3.2.1 实验方法

3.2.2引物设计与选择

3.2.3 LTR反转录转座子片段的克隆和测序

3.3实验结果与分析

3.4.讨论

4.1材料与方法

4.1.1材料

4.1.2方法

4.2数据处理

4.2.1遗传统计和树状图创建

4.2.2 IRAP统计分析

4.2.3种群结构

4.3结果

4.3.1遗传统计

4.3.2刚竹属竹种种质多样性分析

4.3.3 IRAP统计分析

4.3.4刚竹属竹种的种群结构

4.4讨论

4.4.1刚竹属竹种的遗传多样性

4.4.2刚竹属竹种的种群结构

4.4.3刚竹属竹种进化关系分析

5 毛竹变种和雷竹变种 IRAP分子标记遗传分析

5.1材料

5.2 方法

5.2.1 DNA提取

5.2.2 PCR扩增及检测

5.3 数据处理

5.4.1 IRAP在毛竹变种和雷竹变种扩增多态

5.4.2 毛竹变种和雷竹变种遗传多样性分析

5.5讨论

6结论与展望

参考文献

个人简介

致谢