引言
第一章 文献综述
1.1 棉花黄萎病研究进展
1.1.1 棉花黄萎病病害症状
1.1.2 棉花黄萎病菌侵入及致病机理
1.2 植物根系分泌物研究进展
1.2.1 根系分泌物的种类及组成
1.2.2 病原菌与根系分泌物之间的关系
1.3 棉花黄萎病转录组学研究进展
1.4 寄主诱导的基因沉默技术（host-induced gene silencing，HIGS）
第二章 不同抗感棉花品种根系分泌物培养大丽轮枝菌的转录组分析
2.1 材料与方法
2.1.1 棉花品种和V. dahliae菌株
2.1.2 根系分泌物的收集
2.1.3 V. dahliae 的培养
2.1.4 RNA的提取
2.1.5 RNA测序文库的创建和测序
2.1.6 RNA测序数据的分析及差异表达基因的筛选
2.1.7 利用qRT-PCR对差异表达基因进行验证
2.2 结果与分析
2.2.1 不同棉花品种抗病性鉴定
2.2.2 RNA-seq质量评估和转录组模式分析
2.2.3 差异表达基因（DEGs）的筛选
2.2.4 差异基因的GO功能显著性富集分析
2.2.5 V. dahliae和棉花互作相关基因的筛选
2.2.6 V. dahliae致病相关的基因筛选
2.2.7 V. dahliae生长发育相关基因的筛选
2.3 讨论
第三章 高亲和烟酸转运蛋白基因VdNAT1的功能研究
3.1 材料和方法
3.1.1 真菌菌株、质粒和植物材料
3.1.2 V. dahliae分生孢子的收集
3.1.3 VdNAT1基因的克隆及生物信息学分析
3.1.4 VdNAT1基因在感病品种根系分泌物中的表达分析
3.1.5 VdNAT1基因敲除载体和回复表达载体的构建
3.1.6 PEG-CaCl2介导的V. dahliae的遗传转化
3.1.7 缺失突变株和回复突变株的筛选与鉴定
3.1.8 突变体的生理指标鉴定
3.1.9 突变体致病性的测定
3.2 结果与分析
3.2.1 VdNAT1基因的克隆及生物信息学分析
3.2.2 VdNAT1基因在感病品种根系分泌物诱导后的qRT-PCR分析
3.2.3 基因缺失突变株和回复突变株的PCR验证
3.2.4 突变体菌株的生理指标鉴定
3.2.5 添加烟酸后缺失突变株ΔVdNAT1的表型鉴定
3.2.6 缺失突变株和回复突变株的致病力测定
3.3 讨论
第四章 基于HIGS技术的高亲和烟酸转运蛋白基因功能研究
4.1 材料方法
4.1.1 真菌菌株、质粒和植物材料
4.1.2 棉花材料的种植
4.1.3 HIGS沉默载体的构建
4.1.4 棉花的注射
4.1.5 HIGS处理植株的病情调查
4.1.6 真菌生物量和目标基因表达量检测
4.2 结果与分析
4.2.1 HIGS载体的构建
4.2.2 棉花的注射及表型观察
4.2.3 棉花病情调查
4.2.4 真菌生物量和目标基因干扰效果的检测
4.3 讨论
第五章 全文结论与创新点
5.1 全文结论
5.2 全文创新点
5.3有待进一步研究的工作和展望
参考文献
附录
缩写词
作者简介
在学期间主要参与的研究项目
攻读学位期间发表的学术论文
致谢
石河子大学硕士研究生学位论文导师评阅表
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