不同地区F2a志贺菌痢的分子流行病学研究

摘要

目的:应用分子生物学的理论和技术在分子及基因水平上阐明F2a志贺菌的特征,从 而更准确解决传染源、传播途径和有关流行病学问题.方法:运用质粒DNA分析、毒素ShET1/ShET2基因PCR分析、ipaH基因Southern blot分析、16s rRNA基因Southern blot分析及随 机PCR分析方法,在基因水平综合分析各类生物学樗的特性.结论:1.93株来自不同地区, 分离自不同时间的S.flexneri 2a分属于27个克隆群,PT型和RT型分布呈现多态性特征,PT1-ReT1-RT1型是海南、江门、蚌埠、合肥、安庆地区S.flexneri 2a的优势克隆群组;2.首次将ipaH基因探针杂交分析、毒素ShET1/ShET2基因PCR分析引入F2a志贺菌同源克隆鉴定,提 出毒素ShET1/ShET2基因PCR分析是F2a志贺菌同源克隆鉴定不可或缺的分析指标;3.认为毒 素ShET1/ShET2基因PCR检测可用于F2a志贺菌的快速诊断;4.提出16s rRNA编码基因和ipaH 编码基因原Southern blot分析可能不适合于F2a志贺菌的 基因分类.

目录

背 景

摘要

前 言

1材料与方法

1.1菌 株

1.2材料

1.3方法

1.3.1质粒DNA分析

1.3.2毒素ShET1及ShET2基因PCR分析

1.3.3随机PCR分析

1.3.416s rRNA基因Southern blot分析

1.3.5毒素ipaH编码基因Southern blot分析

2结果

2.1流行病学背景

2.2质粒DNA分析

2.3毒素基因PCR分析

2.4PCR分析

2.516s rRNA基因探针杂交分析

2.6ipaH基因探针杂交分析

2.7ipaH基因探针杂交和毒素ShET1及ShET2基因PCR 引入F2a志贺菌同源克隆鉴定系统的评价

3讨论

3.1不同地区、不同时间F2a志贺菌呈克隆多态分布

3.2ipaH基因探针杂交和毒素ShET1及ShET2基因PCR引入F2a志贺菌同源克隆鉴定系统的评价

小 结

参考文献

致 谢

附 录

综述分子流行病学中细菌的核酸分型方法

参考文献