Micro-RNA-146A与汉族人群系统性红斑狼疮遗传易感性的关联分析

摘要

研究背景：系统性红斑狼疮（SLE）是一种临床表现多样化、可累及多个系统的自身免疫性疾病。SLE发病机制尚未明确，是一种多基因病，目前认为与遗传、免疫、病毒感染、药物及激素等因素有关，其中遗传因素在SLE的发病中发挥重要作用。过去二十年，各研究小组主要通过全基因组扫描和候选基因的方法研究SLE的易感基因，但多数结果不尽一致。在线人类孟德尔遗传（OMIM）数据库收录的13个SLE易感基因位点中有11个是通过连锁分析和全基因组扫描发现的，分别是1q41-42（SLEB1）、2q37.3（SLEB2）、4p16-15.2（SLEB3）、12q24（SLEB4）、13q32（SLEB5）、16q11.2（SLEB6）、20p12（SLEB7）、20q13.1（SLEB8）、1q32（SLEB9）、7q32（SLEB10）、2q32.2-q32.3（SLEB11）。通过精细定位和候选基因的方法发现了一些可能与SLE相关的易感基因，如PTPN22、CRP、FCGR2A、FCGR3A、FCGR2B、STAT4、IRF5、TLR5、ITGAM-ITGAX、FAS、PARP、PDCD1、HLA-DRB1、C2、C4等。
　　 近年来随着国际单体图型计划（HapMap）的完成和廉价高效的高通量基因分型技术的出现，全基因组关联分析（GWAS）已成为寻找复杂疾病易感基因最有效的方法。目前已开展了多个SLE易感基因的GWAS研究，其中Harley等报道表明在欧洲人群中5q33.3上的单核苷酸多态性（SNP）rs2431697与SLE相关（P=1.00×10-10，OR=1.22），由于不同种族之间的遗传异质性是SLE发病风险的重要因素，因此值得进一步研究来确定rs2431697是否与其他人群SLE相关。本研究对1993例SLE患者和4770例健康对照（均是汉族人）的SNPrs2431697进行基因分型，探讨5q33.3上的单核苷酸多态性（SNP）rs2431697与汉族人SLE易感性的相关性。此外，通过研究风险相关的SNPrs2431697重组和连锁不平衡（LD）模式，进一步探寻5q33.3区域内的SLE易感基因。
　　 目的：研究5q33.3上的单核苷酸多态性（SNP）rs2431697与汉族人SLE易感性的相关性。探寻5q33.3区域内的SLE易感基因。
　　 方法：利用Sequin MassArray平台对1993例SLE病例和4770例对照的SNP rs2431697位点进行基因型分型。使用MassARRAY Typer软件对SNP rs2431697分型数据进行质谱图分析。风险相关的SNPrs2431697重组和连锁不平衡（LD）模式。
　　 结果：rs2431697与中国汉族人群SLE存在明显关联性(P=6.27×10-11，OR=1.43，95％CI:1.28-1.59)。与欧洲研究结果相比，汉族人群rs2431697位点具有更高的风险等位基因频率（87.16％vs61.52％）以及关联性更强（OR：1.43vs1.22）。SNPrs2431697关联信号位于一大约100kb LD区域，该区域只包含基因微RNA-146A（MIR146A）。
　　 结论：5q33.3上的SNP rs2431697与汉族人群SLE的易感性相关，5q33.3区域内的SLE易感基因可能为Micro-RNA-146A（MIR146A）。