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基于代谢组学的海洋难培养微生物分离培养研究

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摘要

缩略语词汇表

第一章 绪论

1.1.2海洋微生物多样性研究进展

1.2富集分离培养的研究现状

1.3代谢组学的研究进展

1.3.1代谢组学的研究平台

1.3.2代谢组学的应用

1.4短链脂肪酸

1.4.1短链脂肪酸的种类及来源

1.4.2短链脂肪酸的生物学功能研究

1.5本文研究的立题依据与研究内容

第二章基于16S rRNA基因高通量测序对不同富集时期微生物多样性分析

2.1实验材料

2.1.1样品采集

2.1.2富集液配置

2.1.3实验试剂

2.1.4实验仪器

2.2实验方法

2.2.1富集培养

2.2.2高通量样本的采集

2.2.3 Illumina MiSeq高通量测序及序列拼接

2.3实验结果及分析

2.3.1 16S rRNA基因高通量测序基本分析

2.3.2富集培养中微生物的区系组成分析

2.3.3富集培养中微生物类群变化分析

2.4讨论

2.5本章小结

第三章不同富集时期靶向代谢组学研究

3.1实验材料

3.1.1实验样本

3.1.2实验试剂

3.1.3实验仪器

3.2实验方法

3.2.1样本的收集

3.2.2理化指标的测定

3.2.3 200种代谢物的MRM测定

3.2.4短链脂肪酸代谢物测定

3.3实验结果与分析

3.3.1理化因子的变化分析

3.3.2靶向代谢组学的基础分析

3.3.3相关性分析

3.4讨论

3.5本章小结

第四章不同富集时期可培养细菌的分离培养及多样性分析

4.1实验材料

4.1.3分离培养基

4.1.4实验试剂

4.1.5实验仪器

4.2实验方法

4.2.2细菌的分离纯化

4.2.3基于16S rDNA测序的菌株鉴定

4.2.4潜在新菌基因组测序

4.3实验结果与分析

4.3.1菌株分离及分类

4.3.2可培养细菌的多样性分析

4.3.3短脂肪酸代谢途径分析

4.4讨论

4.5本章小结

第五章一株海洋新菌的多相分类

5.1实验材料

5.1.1实验菌株

5.1.2培养基

5.2.1分子遗传学鉴定

5.2.2形态学观察

5.2.3生理生化分析

5.2.4细胞化学组分测定

5.2.5基因组测序分析

5.2.6菌株的保藏

5.3实验结果与分析

5.3.1系统发育分析

5.3.2基因组比较分析

5.3.3表型及生理生化特征

5.3.4化学特征

5.3.5多相分类结论及物种描述

5.4本章小结

6.1全文总结

6.2展望

附录

参考文献

致谢

资助情况

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著录项

  • 作者

    周留艳;

  • 作者单位

    山东大学;

  • 授予单位 山东大学;
  • 学科 生物工程
  • 授予学位 硕士
  • 导师姓名 穆大帅,杜宗军;
  • 年度 2020
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 TS2TQ4;
  • 关键词

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