工艺参数对牛粪厌氧消化抗生素抗性基因丰度和微生物群落结构的影响

目录

声明

一、绪论

1.1 研究背景

1.1.1 畜禽粪便污染现状

1.1.2 抗性基因的来源及在粪便中的赋存

1.1.3 畜禽粪便的厌氧消化对ARGs的影响

1.2 国内外研究现状

1.2.1 温度对ARGs的影响

1.2.2 搅拌对ARGs的影响

1.2.3 固含率对ARGs的影响

1.3 研究目的和意义

1.4 研究内容和技术路线

1.4.1 研究内容

1.4.2 技术路线

二、材料与方法

2.1 材料与方法

2.1.1 试验材料

2.1.2 试验装置

2.1.3 试验设计

2.2 样品采集

2.3 理化指标测定

2.4 DNA提取和定量PCR（qPCR）

2.4.1 DNA提取

2.4.2 qPCR

2.5 微生物群落分析

2.6 数据分析

三、温度对厌氧消化特性、抗生素抗性基因变化及微生物群落的影响

3.1 温度对厌氧消化特性的影响

3.2 温度对ARGs丰度变化的影响

3.2.1 温度对ARGs绝对丰度变化的影响

3.2.2 温度对ARGs相对丰度变化的影响

3.3 温度对MGEs丰度变化的影响

3.3.1 温度对MGEs绝对丰度变化的影响

3.3.2 温度对MGEs相对丰度变化的影响

3.4 温度对微生物群落结构变化的影响

3.4.1 微生物多样性分析

3.4.2 门水平群落组成

3.4.3 属水平群落组成

3.5 小结

四、搅拌对厌氧消化特性、抗生素抗性基因变化及微生物群落的影响

4.1 搅拌对厌氧消化特性的影响

4.2 搅拌对ARGs丰度变化的影响

4.2.1 搅拌对ARGs绝对丰度变化的影响

4.2.2 搅拌对ARGs相对丰度变化的影响

4.3 搅拌对MGEs丰度变化的影响

4.3.1 搅拌对MGEs绝对丰度变化的影响

4.3.2 搅拌对MGEs相对丰度变化的影响

4.4 搅拌对微生物群落结构变化的影响

4.4.1 微生物多样性分析

4.4.2 门水平群落组成

4.4.3 属水平群落组成

4.4.4 ARGs和MGEs和微生物群落以及环境因子之间的关系

4.5 小结

五、固含率对厌氧消化特性、抗生素抗性基因变化及微生物群落的影响

5.1 固含率对厌氧消化特性的影响

5.2 固含率对ARGs丰度变化的影响

5.2.1 ARGs绝对丰度变化

5.2.2 ARGs相对丰度变化

5.3 固含率对MGEs丰度变化的影响

5.3.1 固含率对MGEs绝对丰度变化的影响

5.3.2 固含率对MGEs相对丰度变化的影响

5.4 固含率对微生物群落结构变化的影响

5.4.1 微生物多样性分析

5.4.2 门水平群落组成

5.4.3 属水平群落组成

5.4.4 ARGs和MGEs与微生物群落和环境因子之间的关系

5.5 小结

六、结论与展望

6.1 结论

6.2 展望

参考文献

致谢