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摘要
缩略词表
第一章文献综述
1 茶氨酸在茶树体内的代谢研究
1.1 茶氨酸在茶树体内的代谢途径研究
1.2茶氨酸在茶树体内的分布变化规律研究
2谷氨酸合成酶的研究现状
2.1谷氨酸合成酶的结构和功能研究
2.2谷氨酸合成酶的表达与调控
2.3谷氨酸合成酶转基因功能验证
3茶树氮代谢的研究现状
3.1茶树对氮素吸收和同化
3.2氮素对茶树生长发育的调控
3.3氮素对茶树代谢的调控
4组学在茶树中的应用研究
4.1转录组学在茶树中的应用研究
4.2蛋白组学在茶树中的应用研究
4.3 miRNA组学在茶树中的应用研究
5本研究的目的和意义
第二章L-茶氨酸合成和基因表达的相关性研究
1材料和方法
1.1茶树种植和取样
1.2茶氨酸含量测定
1.3总RNA提取和cDNA合成
1.4基因鉴定、克隆和引物设计
1.5 qRT-PCR分析
1.6数据分析
2结果
2.1 三个茶树品种的不同组织中的茶氨酸含量
2.2鉴定茶树中编码茶氨酸代谢相关酶的基因
2.3三种茶树不同组织中与茶氨酸代谢相关基因的表达谱
2.4茶氨酸含量与基因表达量的相关性分析
3讨论
3.1不同茶树品种、组织之间的茶氨酸含量分布
3.2不同茶树品种、组织之间的茶氨酸代谢相关基因的表达谱分析
3.3茶氨酸含量与基因表达水平的相关性分析
第三章谷氨酸合成酶在采后摊放茶叶的茶氨酸代谢中的重要性研究
1材料与方法
1.1植物材料和摊放处理
1.2茶氨酸代谢相关的差异表达蛋白的鉴定和分析
1.3酵母双杂交验证
1.4超高效液相色谱(UPLC)检测茶氨酸含量
1.5 qRT-PCR分析
1.6数据分析
2结论
2.1 不同条件下采后摊放茶叶中茶氨酸合成相关差异蛋白的鉴定
2.2差异蛋白基因CsFd-GOGAT和CsNADH-GOGAT的序列分析
2.3不同温度和遮阴条件下采后摊放茶叶中茶氨酸含量的变化
2.4茶氨酸代谢相关酶之间的互作分析
2.5茶氨酸代谢相关基因表达谱分析
2.6茶氨酸含量和相关基因与蛋白表达水平的关联分析
3讨论
3.1不同温度和遮阴处理采后茶叶中茶氨酸合成途径相关的差异蛋白
3.2不同温度条件下茶氨酸动态变化、DEPs和相关基因表达谱分析
3.3遮阴条件下茶氨酸动态变化、DEPs和相关基因表达谱分析
第四章基于转录组分析缺氮处理下茶氨酸代谢机制
1材料与方法
1.1植物材料与缺氮处理
1.2测定氨基酸含量
1.3总RNA提取、检测和构建文库
1.4测序数据过滤及比对基因组
1.5新转录本预测
1.6差异表达基因(DEGs)筛选及富集分析
1.7 qRT-PCR分析
2结果与分析
2.1测序数据概况
2.2参考基因组比对结果统计
2.3差异基因表达检测
2.4差异基因的GO和KEGG富集分析
2.5茶氨酸代谢相关的基因鉴定
2.6氨基酸在不同组织中在不同氮营养条件下的动态分布
2.7茶氨酸含量与6种蛋白氨基酸含量、基因表达量的相关’l生分析
2.8茶氨酸代谢相关差异表达基因鉴定
3讨论
3.1茶树不同组织响应缺氮胁迫的整体转录模式
3.2茶氨酸代谢相关基因及差异表达基因
3.3茶氨酸含量动态变化与6种蛋白氨基酸、相关基因表达的相关性分析
第五章基于蛋白组分析缺氮处理下茶氨酸代谢机制
1材料方法
1.1植物材料和缺氮处理
1.2茶氨酸代谢关键酶活性测定
1.3蛋白质提取、消化和iTRAQ标记
1.5蛋白质鉴定、定量和富集分析
1.6蛋白组和转录组关联分析
2结果
2.1 茶树新稍和根在缺氮处理下的蛋白组学鉴定
2.2差异表达蛋白的GO分析
2.3差异表达蛋白的Pathway富集分析
2.4蛋白组和转录组的关联分析
2.5关联蛋白的GO和KEGG pathway富集分析
2.6茶氨酸代谢相关差异蛋白鉴定
2.7茶氨酸合成关键酶活性与茶氨酸含量的关联分析
3 讨论
3.1 茶树新稍和根缺氮处理下差异蛋白的鉴定和分析
3.2茶氨酸代谢相关的关联蛋白分析
第六章基于microRNA组分析缺氮处理下茶氨酸代谢机制
1材料与方法
1.1植物材料和缺氮处理
1.2 microRNA提取检测、建库和测序
1.3数据质控
1.4比对分析和新miRNA预测
1.5 miRNA表达量分析及DEMs筛选
1.6 miRNA和mRNA关联分析
1.7 miRNA表达的qRT-PCR验证
2结果
2.1 miRNA测序概况分析
2.2比对分析和新miRNA预测
2.3鉴定差异表达miRNA(DEMs)及其靶基因预测
2.4 DEMs与DEGs关联分析
2.5茶氨酸代谢相关DEMs-DEGs负关系对的鉴定和qRT-PCR验证
3 讨论
3.1 茶树新稍和根在氮缺乏和充足条件下的miRNA序列特征
3.2 DEMs的鉴定及DEMs-DEGs关联分析
全文结论
创新点
参考文献
附录
攻读博士学位期间发表论文及获奖情况
致谢
南京农业大学;