中气门目和疥螨目螨类进化线粒体基因组学研究

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摘要

第一章文献综述

1线粒体基因组

1．1线粒体

1．2线粒体基因组

2蜱螨亚纲线粒体基因组特征

2．1蜱螨亚纲线粒体基因组结构特点

2．2蜱螨亚纲线粒体基因组的重排

2．3蜱螨亚纲线粒体tRNA二级结构特征

3系统发育基因组学发展现状

3．1系统发育基因组学的概述

3．2系统发育基因组学的常用分析方法

4本研究的意义和思路

第二章中气门目线粒体基因组结构基因组学研究

1材料与方法

1．1样本的采集

1．2玻片制作和形态鉴定

1．3 DNA提取和线粒体基因组克隆测序

1．4线粒体基因组拼接、注释和分析

2结果与分析

2．1中气门目七种螨的线粒体基因组扩增结果

2．2中气门目七种螨的线粒体基因组注释

2．3线粒体基因组基因排序

2．4 tRNA二级结构分析

3讨论

第三章中气门目螨类线粒体基因重排研究

1材料与方法

1．1研究使用类群的选取信息

1．2系统发育分析

1．3基因断点值分析

1．4碱基偏斜的分析

1．5四倍简并位点分析

2结果与分析

2．1基于线粒体基因组的寄螨总目的系统发育分析

2．2基因断点值

2．3碱基偏斜

2．4四倍简并位点

3讨论

第四章疥螨目线粒体基因组tRNA基因结构研究

1材料与方法

1．1 DNA提取和线粒体基因组克隆测序

1．2线粒体基因组拼接、注释和分析

2结果与分析

2．1线粒体基因组的注释与分析

2．2疥螨目线粒体tRNA基因丢失分析

2．3疥螨目螨类线粒体基因组密码子使用分析

3讨论

全文总结

参考文献

附录

学术论文发表情况

致谢