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影响公鸡鸡冠发育的差异基因的筛选与表达分析

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摘要

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第一章文献综述

1鸡冠性状的研究进展

1.1鸡冠的结构及化学组成

1.2影响鸡冠发育的因素

1.3鸡冠性状与生产和繁殖性能的关系

1.4鸡冠性状与鸡行为学以及疾病的联系

2.1 RNA-seq技术的优势

2.2 RNA-seq技术在鸡冠中的应用

3鸡冠发育相关的候选基因

3.2 DRD1基因

3.3 DRD2基因

3.4 BMP2基因

4研究的目的与意义

第二章公鸡鸡冠发育相关候选基因的筛选与分析

1 试验材料

1.1试验动物

1.2主要试剂及仪器

2试验方法

2.1样品采集

2.2石蜡切片

2.3HE染色

2.4 RNA提取和质量检测

2.5文库的构建和测序

2.6测序数据质控和基因组比对

2.7差异表达基因的筛选

2.8差异表达基因的GO和KEGG Pathway富集分析

2.9差异表达基因的蛋白互作网络分析

2.10差异基因荧光定量PCR验证

2.11统计分析

3 试验结果

3.1测序样品的表型分析

3.2高、矮鸡冠的组织学结构观察

3.3 RNA样品质量检测

3.4测序数据质量分析

3.5参考基因组比对

3.6基因表达水平分析

3.7差异表达基因筛选

3.8 qRT-PCR结果验证

3.9差异基因的GO功能分类和KEGG pathway显著性富集分析

3.10蛋白互作网络分析

4讨论

4.1本研究试验群体和分析方案的选择

4.2鸡冠发育的关键基因

4.3参与鸡冠发育的信号通路

4.4差异表达基因的蛋白互作网络

5结论

第三章不同周龄公鸡鸡冠组织学观察和BMP2、CHADL参与公鸡鸡冠发育的表达分析

1材料与方法

1.1 试验动物

1.2主要试剂和仪器

2试验方法

2.1样品采集

2.2 RNA提取

2.3 qRT-PCR

2.4石蜡切片

2.5 HE染色

2.6统计分析

3试验结果

3.1 不同周龄的鸡冠发育性状

3.2不同周龄鸡冠组织形态变化

3.3 BMP2和CHADL在不同周龄鸡冠组织的表达水平

3.4 BMP2和CHADL的组织表达谱

4讨论

4.1不同周龄鸡冠组织形态

4.2 BMP2在公鸡不同组织和鸡冠不同周龄的表达特性

4.3 CHADL在公鸡不同组织和鸡冠不同周龄的表达特性

5结论

参考文献

全文结论

攻读硕士学位期间发表的论文

致谢

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著录项

  • 作者

    王琨;

  • 作者单位

    南京农业大学;

  • 授予单位 南京农业大学;
  • 学科 畜牧学;动物生物工程
  • 授予学位 硕士
  • 导师姓名 虞德兵,束婧婷;
  • 年度 2018
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 S85S83;
  • 关键词

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