声明
摘要
缩略词
第一章文献综述
1鸡冠性状的研究进展
1.1鸡冠的结构及化学组成
1.2影响鸡冠发育的因素
1.3鸡冠性状与生产和繁殖性能的关系
1.4鸡冠性状与鸡行为学以及疾病的联系
2.1 RNA-seq技术的优势
2.2 RNA-seq技术在鸡冠中的应用
3鸡冠发育相关的候选基因
3.2 DRD1基因
3.3 DRD2基因
3.4 BMP2基因
4研究的目的与意义
第二章公鸡鸡冠发育相关候选基因的筛选与分析
1 试验材料
1.1试验动物
1.2主要试剂及仪器
2试验方法
2.1样品采集
2.2石蜡切片
2.3HE染色
2.4 RNA提取和质量检测
2.5文库的构建和测序
2.6测序数据质控和基因组比对
2.7差异表达基因的筛选
2.8差异表达基因的GO和KEGG Pathway富集分析
2.9差异表达基因的蛋白互作网络分析
2.10差异基因荧光定量PCR验证
2.11统计分析
3 试验结果
3.1测序样品的表型分析
3.2高、矮鸡冠的组织学结构观察
3.3 RNA样品质量检测
3.4测序数据质量分析
3.5参考基因组比对
3.6基因表达水平分析
3.7差异表达基因筛选
3.8 qRT-PCR结果验证
3.9差异基因的GO功能分类和KEGG pathway显著性富集分析
3.10蛋白互作网络分析
4讨论
4.1本研究试验群体和分析方案的选择
4.2鸡冠发育的关键基因
4.3参与鸡冠发育的信号通路
4.4差异表达基因的蛋白互作网络
5结论
第三章不同周龄公鸡鸡冠组织学观察和BMP2、CHADL参与公鸡鸡冠发育的表达分析
1材料与方法
1.1 试验动物
1.2主要试剂和仪器
2试验方法
2.1样品采集
2.2 RNA提取
2.3 qRT-PCR
2.4石蜡切片
2.5 HE染色
2.6统计分析
3试验结果
3.1 不同周龄的鸡冠发育性状
3.2不同周龄鸡冠组织形态变化
3.3 BMP2和CHADL在不同周龄鸡冠组织的表达水平
3.4 BMP2和CHADL的组织表达谱
4讨论
4.1不同周龄鸡冠组织形态
4.2 BMP2在公鸡不同组织和鸡冠不同周龄的表达特性
4.3 CHADL在公鸡不同组织和鸡冠不同周龄的表达特性
5结论
参考文献
全文结论
攻读硕士学位期间发表的论文
致谢
南京农业大学;