长春地区小儿手足口病的流行病学调查及病原体柯萨奇病毒A4(CoxA4)的分子进化研究

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第一章 绪论

1.1 手足口病及其病原体概述

1.1.1 手足口病概述

1.1.2 简述手足口病的流行状况

1.1.3 与手足口病相关的特殊病原体

1.2 CoxA4的病原学基础

1.2.1 CoxA4的基因组特征

1.2.2 CoxA4临床表现

1.3 生物信息学及分子进化研究

1.3.1 生物信息学概论

1.3.2 分子进化研究

1.3.3 病毒的同源性重组

第二章 流行病学调查

2.1 材料与方法

2.1.1 样本采集

2.1.2 依据标准

2.1.3 统计学处理

2.2 统计结果

2.2.1 手足口病例概况

2.2.2 年龄、性别统计

2.2.3 患儿主要活动范围分布

2.2.4 病原学监测结果

2.2.5 CoxA16感染的年龄分布特征

2.2.6 不同手足口病病原感染的临床表现

第三章 CoxA4的分子进化研究

3.1 实验材料

3.1.1 数据处理软件与下载地址

3.1.2 数据来源

3.2 实验方法

3.2.1 获取CoxA4 VP1序列

3.2.2 数据的处理

3.2.3 应用BEAST对CoxA4 VP1进行进化分析

3.3 结果

3.3.1 CoxA4 VP1序列的饱和度检测结果

3.3.2 最适核酸替代模型的计算

3.3.3 构建CoxA4 VP1最大可信分支树（MCC）

3.3.4 D型CoxA4在中国的广泛传播

3.3.5 绘制CoxA4 VP1的BSP

3.3.6 231株CoxA4 VP1种群的进化率与密码子的突变率

3.3.7 CoxA4的重组分析

第四章 讨论

第五章 结论

参考文献

作者简介及在学期间所取得的科研成果

致谢